中国草地学报
中國草地學報
중국초지학보
Chinese Journal of Grassland
2015年
5期
5-10
,共6页
董园园%王法微%王南%李晓薇%李海燕
董園園%王法微%王南%李曉薇%李海燕
동완완%왕법미%왕남%리효미%리해연
微小RNA%羊草%靶基因%生物信息学分析%颈环结构
微小RNA%羊草%靶基因%生物信息學分析%頸環結構
미소RNA%양초%파기인%생물신식학분석%경배결구
MicroRNA%Leymus chinensis%Target gene%Bioinformatics analysis%Hairpin structure
为鉴定羊草microRNA基因信息并明确其在羊草生长发育、抗逆过程中的调控作用,用羊草small RNA的SRA数据,根据miRBase21.0信息比对,分别获得隶属于39个microRNA家族的141个已知microRNA基因及新注释的6个novel microRNA,并且预测到新microRNA的二级结构为颈环结构.利用单子叶植物ESTs文库预测到1196个靶基因信息,对羊草microRNA基因具有调控作用.Nr注释及COG注释显示多数靶基因参与羊草的信号转导过程,揭示microRNA参与了羊草的生长发育、新陈代谢、逆境调控等.
為鑒定羊草microRNA基因信息併明確其在羊草生長髮育、抗逆過程中的調控作用,用羊草small RNA的SRA數據,根據miRBase21.0信息比對,分彆穫得隸屬于39箇microRNA傢族的141箇已知microRNA基因及新註釋的6箇novel microRNA,併且預測到新microRNA的二級結構為頸環結構.利用單子葉植物ESTs文庫預測到1196箇靶基因信息,對羊草microRNA基因具有調控作用.Nr註釋及COG註釋顯示多數靶基因參與羊草的信號轉導過程,揭示microRNA參與瞭羊草的生長髮育、新陳代謝、逆境調控等.
위감정양초microRNA기인신식병명학기재양초생장발육、항역과정중적조공작용,용양초small RNA적SRA수거,근거miRBase21.0신식비대,분별획득대속우39개microRNA가족적141개이지microRNA기인급신주석적6개novel microRNA,병차예측도신microRNA적이급결구위경배결구.이용단자협식물ESTs문고예측도1196개파기인신식,대양초microRNA기인구유조공작용.Nr주석급COG주석현시다수파기인삼여양초적신호전도과정,게시microRNA삼여료양초적생장발육、신진대사、역경조공등.
