广东农业科学
廣東農業科學
엄동농업과학
Guangdong Agricultural Sciences
2015年
18期
127-131
,共5页
杨明禄%陈世有%付彬%韩旭%金强%董红强
楊明祿%陳世有%付彬%韓旭%金彊%董紅彊
양명록%진세유%부빈%한욱%금강%동홍강
库尔勒香梨%EST-SSR%遗传多样性
庫爾勒香梨%EST-SSR%遺傳多樣性
고이륵향리%EST-SSR%유전다양성
利用已公开的梨EST序列(2 398条)开发SSR引物,分析梨EST序列中SSR分布及特征,针对库尔勒香梨进行引物筛选,并分析受香梨优斑螟为害程度差异较大香梨18株样本的遗传多样性.结果表明:EST序列中有1 813条无冗余序列,141条含162个SSR,占全部EST的7.78％,出现频率8.94％,平均分布距离为4.93 kb,但不同微卫星的重复类型间差异很大(9.51～79.87 kb),二核苷酸重复最为常见,占SSR比例达到51.85％.从设计的123对引物中,选取41对SSR引物进行筛选,发现17对引物扩增效果和多态性较好,共检测出111条多态性条带,等位基因Na为5.53,有效等位基因数Ne为3.74,Nei's基因多样性指数He为0.69,Shannon's多样性指数Ⅰ为1.40,受害较重的G组香梨个体主要集中在UPGMA聚类的0.78分支处.
利用已公開的梨EST序列(2 398條)開髮SSR引物,分析梨EST序列中SSR分佈及特徵,針對庫爾勒香梨進行引物篩選,併分析受香梨優斑螟為害程度差異較大香梨18株樣本的遺傳多樣性.結果錶明:EST序列中有1 813條無冗餘序列,141條含162箇SSR,佔全部EST的7.78％,齣現頻率8.94％,平均分佈距離為4.93 kb,但不同微衛星的重複類型間差異很大(9.51～79.87 kb),二覈苷痠重複最為常見,佔SSR比例達到51.85％.從設計的123對引物中,選取41對SSR引物進行篩選,髮現17對引物擴增效果和多態性較好,共檢測齣111條多態性條帶,等位基因Na為5.53,有效等位基因數Ne為3.74,Nei's基因多樣性指數He為0.69,Shannon's多樣性指數Ⅰ為1.40,受害較重的G組香梨箇體主要集中在UPGMA聚類的0.78分支處.
이용이공개적리EST서렬(2 398조)개발SSR인물,분석리EST서렬중SSR분포급특정,침대고이륵향리진행인물사선,병분석수향리우반명위해정도차이교대향리18주양본적유전다양성.결과표명:EST서렬중유1 813조무용여서렬,141조함162개SSR,점전부EST적7.78％,출현빈솔8.94％,평균분포거리위4.93 kb,단불동미위성적중복류형간차이흔대(9.51～79.87 kb),이핵감산중복최위상견,점SSR비례체도51.85％.종설계적123대인물중,선취41대SSR인물진행사선,발현17대인물확증효과화다태성교호,공검측출111조다태성조대,등위기인Na위5.53,유효등위기인수Ne위3.74,Nei's기인다양성지수He위0.69,Shannon's다양성지수Ⅰ위1.40,수해교중적G조향리개체주요집중재UPGMA취류적0.78분지처.
