数学物理学报
數學物理學報
수학물이학보
Acta Mathematica Scientia
2015年
5期
1018-1024
,共7页
黎妍%张晓飞%易鸣%刘妍岩
黎妍%張曉飛%易鳴%劉妍巖
려연%장효비%역명%류연암
基因调控网络%直接相关%间接相关%皮尔逊相关系数%斯皮尔曼等级相关系数%互信息
基因調控網絡%直接相關%間接相關%皮爾遜相關繫數%斯皮爾曼等級相關繫數%互信息
기인조공망락%직접상관%간접상관%피이손상관계수%사피이만등급상관계수%호신식
Gene regulatory networks%Direct correlation%Indirect correlation%Pearson correlation%Spearman rank correlation%Mutual information
为构建基因调控网络,提出了一个基于基因表达水平和网络反传递的算法.该算法用网络反传递思想来分析由传统相关性计算方法产生的间接效果,并考虑了调控网络的稀疏性,在模型算法中加入了控制网络稀疏性的l1范数惩罚项.在大肠杆菌实验数据上测试该算法,这种方法提高了相关性分析对调控网络中边的预测能力,皮尔逊相关系数提高了6.42％,斯皮尔曼相关系数提高了5.92％,互信息提高了9.35％.总的来说,这个模型为修饰大量系统的相关性数据提供一种新思路,可以应用到网络边的预测和推断生物网络的控制动力学中.
為構建基因調控網絡,提齣瞭一箇基于基因錶達水平和網絡反傳遞的算法.該算法用網絡反傳遞思想來分析由傳統相關性計算方法產生的間接效果,併攷慮瞭調控網絡的稀疏性,在模型算法中加入瞭控製網絡稀疏性的l1範數懲罰項.在大腸桿菌實驗數據上測試該算法,這種方法提高瞭相關性分析對調控網絡中邊的預測能力,皮爾遜相關繫數提高瞭6.42％,斯皮爾曼相關繫數提高瞭5.92％,互信息提高瞭9.35％.總的來說,這箇模型為脩飾大量繫統的相關性數據提供一種新思路,可以應用到網絡邊的預測和推斷生物網絡的控製動力學中.
위구건기인조공망락,제출료일개기우기인표체수평화망락반전체적산법.해산법용망락반전체사상래분석유전통상관성계산방법산생적간접효과,병고필료조공망락적희소성,재모형산법중가입료공제망락희소성적l1범수징벌항.재대장간균실험수거상측시해산법,저충방법제고료상관성분석대조공망락중변적예측능력,피이손상관계수제고료6.42％,사피이만상관계수제고료5.92％,호신식제고료9.35％.총적래설,저개모형위수식대량계통적상관성수거제공일충신사로,가이응용도망락변적예측화추단생물망락적공제동역학중.
