陕西林业科技
陝西林業科技
협서임업과기
Shaanxi Forest Science and Technology
2015年
4期
145-154
,共10页
基因组选择%有效群体大小%连锁不平衡%标记辅助选择(MAS)
基因組選擇%有效群體大小%連鎖不平衡%標記輔助選擇(MAS)
기인조선택%유효군체대소%련쇄불평형%표기보조선택(MAS)
基因组选择(GS,也称全基因组选择)是利用捕捉到一个乃至多个数量性状大多数基因位点的全基因组标记估计基因组育种值(即所有标记效应的总和),并以此对目标性状进行选择的方法.目前,这种新的选择方法正在给家畜育种实践带来一场革命性的变化.同样的方法和设想也适用于林木育种.事实上,漫长的世代时间以及大多数复杂性状晚期表达的特性历来都是林木育种所面临的巨大困难和挑战.不仅如此,林木植物还具备诸多其它的有利条件有助于GS的开展和应用,例如:易于收集并建立较大的参考群体且某些性状已作过准确的表型分析;一些改良群体的连锁不平衡(LD)程度较高,这其中包括林木高世代育种程序中所常用到的一些有效群体大小(Ne)较小的群体.本研究利用确定性方程就LD(通过Ne和标记间距离进行模拟),训练集的大小,性状遗传力,以及数量性状位点(QTL)的数目等因素对GS的预期准确性的影响进行了分析评估.结果显示,GS有可能使树木育种的有效性得到根本性的提高.当Ne≤30时,即便标记密度仅大约2个标记/厘摩(cM),采用GS就能达到传统BLUP(最佳线性无偏预测)选择的基准精度.不过,当Ne较大时,标记密度则需达到20个标记/cM.采用GS可使育种周期缩短50%,进而使育种效率增加100%或以上.随着技术的快速进步和基因分型成本的下降,我们谨慎而乐观地看好GS在加速树木育种进程和提高育种效率上的巨大潜力.不过,在将此项技术推广应用之前,尚需作进一步的模拟研究及概念验证试验.
基因組選擇(GS,也稱全基因組選擇)是利用捕捉到一箇迺至多箇數量性狀大多數基因位點的全基因組標記估計基因組育種值(即所有標記效應的總和),併以此對目標性狀進行選擇的方法.目前,這種新的選擇方法正在給傢畜育種實踐帶來一場革命性的變化.同樣的方法和設想也適用于林木育種.事實上,漫長的世代時間以及大多數複雜性狀晚期錶達的特性歷來都是林木育種所麵臨的巨大睏難和挑戰.不僅如此,林木植物還具備諸多其它的有利條件有助于GS的開展和應用,例如:易于收集併建立較大的參攷群體且某些性狀已作過準確的錶型分析;一些改良群體的連鎖不平衡(LD)程度較高,這其中包括林木高世代育種程序中所常用到的一些有效群體大小(Ne)較小的群體.本研究利用確定性方程就LD(通過Ne和標記間距離進行模擬),訓練集的大小,性狀遺傳力,以及數量性狀位點(QTL)的數目等因素對GS的預期準確性的影響進行瞭分析評估.結果顯示,GS有可能使樹木育種的有效性得到根本性的提高.噹Ne≤30時,即便標記密度僅大約2箇標記/釐摩(cM),採用GS就能達到傳統BLUP(最佳線性無偏預測)選擇的基準精度.不過,噹Ne較大時,標記密度則需達到20箇標記/cM.採用GS可使育種週期縮短50%,進而使育種效率增加100%或以上.隨著技術的快速進步和基因分型成本的下降,我們謹慎而樂觀地看好GS在加速樹木育種進程和提高育種效率上的巨大潛力.不過,在將此項技術推廣應用之前,尚需作進一步的模擬研究及概唸驗證試驗.
기인조선택(GS,야칭전기인조선택)시이용포착도일개내지다개수량성상대다수기인위점적전기인조표기고계기인조육충치(즉소유표기효응적총화),병이차대목표성상진행선택적방법.목전,저충신적선택방법정재급가축육충실천대래일장혁명성적변화.동양적방법화설상야괄용우림목육충.사실상,만장적세대시간이급대다수복잡성상만기표체적특성력래도시림목육충소면림적거대곤난화도전.불부여차,림목식물환구비제다기타적유리조건유조우GS적개전화응용,례여:역우수집병건립교대적삼고군체차모사성상이작과준학적표형분석;일사개량군체적련쇄불평형(LD)정도교고,저기중포괄림목고세대육충정서중소상용도적일사유효군체대소(Ne)교소적군체.본연구이용학정성방정취LD(통과Ne화표기간거리진행모의),훈련집적대소,성상유전력,이급수량성상위점(QTL)적수목등인소대GS적예기준학성적영향진행료분석평고.결과현시,GS유가능사수목육충적유효성득도근본성적제고.당Ne≤30시,즉편표기밀도부대약2개표기/전마(cM),채용GS취능체도전통BLUP(최가선성무편예측)선택적기준정도.불과,당Ne교대시,표기밀도칙수체도20개표기/cM.채용GS가사육충주기축단50%,진이사육충효솔증가100%혹이상.수착기술적쾌속진보화기인분형성본적하강,아문근신이악관지간호GS재가속수목육충진정화제고육충효솔상적거대잠력.불과,재장차항기술추엄응용지전,상수작진일보적모의연구급개념험증시험.