吉林农业
吉林農業
길임농업
JILIN NONGYE
2015年
22期
60-61
,共2页
王好%于丹%刘丽凡%王友超%周井祥
王好%于丹%劉麗凡%王友超%週井祥
왕호%우단%류려범%왕우초%주정상
锦鲤疱疹病毒%ORF108基因%生物信息学分析
錦鯉皰疹病毒%ORF108基因%生物信息學分析
금리포진병독%ORF108기인%생물신식학분석
为研究我国锦鲤疱疹病毒的基因背景信息,从锦鲤疱疹病毒中国吉林株(KHV-CJ株)获得ORF108基因,应用生物信息学方法分析KHV-CJ株ORF108基因结构和功能.结果显示,ORF108基因长588bp,为一完整的开放阅读框,编码196个氨基酸,理论分子质量为21207.37Da.KHV-CJ株与美国株(KHV-U)的ORF108基因的序列一致性为99%,在第564位的碱基A突变为G.但该突变位置编码的氨基酸并没有发生改变,同为丝氨酸.ORF108基因编码蛋白的1-61位氨基酸位于细胞膜表面,62-84位氨基酸之间形成一个典型的跨膜螺旋区.该蛋白的表面抗原决定簇位点区域广泛、峰值高,预示该基因可作为基因工程疫苗的重要候选基因.
為研究我國錦鯉皰疹病毒的基因揹景信息,從錦鯉皰疹病毒中國吉林株(KHV-CJ株)穫得ORF108基因,應用生物信息學方法分析KHV-CJ株ORF108基因結構和功能.結果顯示,ORF108基因長588bp,為一完整的開放閱讀框,編碼196箇氨基痠,理論分子質量為21207.37Da.KHV-CJ株與美國株(KHV-U)的ORF108基因的序列一緻性為99%,在第564位的堿基A突變為G.但該突變位置編碼的氨基痠併沒有髮生改變,同為絲氨痠.ORF108基因編碼蛋白的1-61位氨基痠位于細胞膜錶麵,62-84位氨基痠之間形成一箇典型的跨膜螺鏇區.該蛋白的錶麵抗原決定簇位點區域廣汎、峰值高,預示該基因可作為基因工程疫苗的重要候選基因.
위연구아국금리포진병독적기인배경신식,종금리포진병독중국길림주(KHV-CJ주)획득ORF108기인,응용생물신식학방법분석KHV-CJ주ORF108기인결구화공능.결과현시,ORF108기인장588bp,위일완정적개방열독광,편마196개안기산,이론분자질량위21207.37Da.KHV-CJ주여미국주(KHV-U)적ORF108기인적서렬일치성위99%,재제564위적감기A돌변위G.단해돌변위치편마적안기산병몰유발생개변,동위사안산.ORF108기인편마단백적1-61위안기산위우세포막표면,62-84위안기산지간형성일개전형적과막라선구.해단백적표면항원결정족위점구역엄범、봉치고,예시해기인가작위기인공정역묘적중요후선기인.
