南方农业学报
南方農業學報
남방농업학보
Journal of Southern Agriculture
2015年
8期
1505-1510
,共6页
黄建芳%鄢胜飞%吴敏%陈秋明%周亭亭%蒋钦杨%郭亚芬%兰干球
黃建芳%鄢勝飛%吳敏%陳鞦明%週亭亭%蔣欽楊%郭亞芬%蘭榦毬
황건방%언성비%오민%진추명%주정정%장흠양%곽아분%란간구
陆川猪%HSP90基因%克隆%序列分析
陸川豬%HSP90基因%剋隆%序列分析
륙천저%HSP90기인%극륭%서렬분석
Luchuan pig%HSP90 gene%clone%sequence analysis
[目的]对陆川猪热休克蛋白90 (HSP90)基因进行克隆与序列分析,为研究HSP90与陆川猪抗热应激的相关性及寻找猪耐热性分子标记奠定基础.[方法]根据GenBank已发表的猪HSP90基因序列(登录号NM 213973.1)设计引物,RT-PCR扩增HSP90基因编码区序列,并应用LaserGene、MegAlign等生物软件进行序列分析及蛋白质结构预测.[结果]克隆获得陆川猪HSP90基因编码区序列长2202 bp,编码733个氨基酸,分子质量84774.8 U,理论等电点4.93;与野猪的亲缘关系最近,其氨基酸同源性为100.0％,与牛、绵羊、人类、大猩猩的氨基酸同源性也在96.2％以上.陆川猪HSP90蛋白N端有1个HATPase_c superfamily保守结构域,C端最末端有一个MEEVD保守序列,氨基酸序列中存在5个HSP90家族特有保守信号区,其成熟肽包含有α螺旋、β转角、延长线和无规卷曲4种二级结构元件.[结论]猪HSP90基因高度保守,可作为研究陆川猪抗热应激的候选基因之一.
[目的]對陸川豬熱休剋蛋白90 (HSP90)基因進行剋隆與序列分析,為研究HSP90與陸川豬抗熱應激的相關性及尋找豬耐熱性分子標記奠定基礎.[方法]根據GenBank已髮錶的豬HSP90基因序列(登錄號NM 213973.1)設計引物,RT-PCR擴增HSP90基因編碼區序列,併應用LaserGene、MegAlign等生物軟件進行序列分析及蛋白質結構預測.[結果]剋隆穫得陸川豬HSP90基因編碼區序列長2202 bp,編碼733箇氨基痠,分子質量84774.8 U,理論等電點4.93;與野豬的親緣關繫最近,其氨基痠同源性為100.0％,與牛、綿羊、人類、大猩猩的氨基痠同源性也在96.2％以上.陸川豬HSP90蛋白N耑有1箇HATPase_c superfamily保守結構域,C耑最末耑有一箇MEEVD保守序列,氨基痠序列中存在5箇HSP90傢族特有保守信號區,其成熟肽包含有α螺鏇、β轉角、延長線和無規捲麯4種二級結構元件.[結論]豬HSP90基因高度保守,可作為研究陸川豬抗熱應激的候選基因之一.
[목적]대륙천저열휴극단백90 (HSP90)기인진행극륭여서렬분석,위연구HSP90여륙천저항열응격적상관성급심조저내열성분자표기전정기출.[방법]근거GenBank이발표적저HSP90기인서렬(등록호NM 213973.1)설계인물,RT-PCR확증HSP90기인편마구서렬,병응용LaserGene、MegAlign등생물연건진행서렬분석급단백질결구예측.[결과]극륭획득륙천저HSP90기인편마구서렬장2202 bp,편마733개안기산,분자질량84774.8 U,이론등전점4.93;여야저적친연관계최근,기안기산동원성위100.0％,여우、면양、인류、대성성적안기산동원성야재96.2％이상.륙천저HSP90단백N단유1개HATPase_c superfamily보수결구역,C단최말단유일개MEEVD보수서렬,안기산서렬중존재5개HSP90가족특유보수신호구,기성숙태포함유α라선、β전각、연장선화무규권곡4충이급결구원건.[결론]저HSP90기인고도보수,가작위연구륙천저항열응격적후선기인지일.
