南方农业学报
南方農業學報
남방농업학보
Journal of Southern Agriculture
2015年
8期
1350-1355
,共6页
史卫东%琚茜茜%张力%罗海玲%熊发前%康红卫
史衛東%琚茜茜%張力%囉海玲%熊髮前%康紅衛
사위동%거천천%장력%라해령%웅발전%강홍위
菜心%遗传多样性%SCoT%聚类分析
菜心%遺傳多樣性%SCoT%聚類分析
채심%유전다양성%SCoT%취류분석
Chinese flowering cabbage (Brassica Campestris L.ssp.chinensis Var.utilis Tsen et Le)%genetic diversity%SCoT%cluster analysis
[目的]利用SCoT标记分析菜心种质资源的遗传多样性,为其分类和利用提供理论依据.[方法]搜集熟期和株色各异的33份菜心种质资源,利用筛选的12条SCoT引物对其进行遗传多样性分析.[结果]12条引物从33份菜心共扩增出83条带,引物多态性百分率变化范围为2.63％～57.89％,平均多态性百分率为36.00％;每条引物多态性条带变化范围为4～9条,平均3.4条;扩增片段大小为500～1500 bp.观察等位基因数(Na)为1.065,有效等位基因数(Ne)为1.254,Shannon's信息多样性指数(Ⅰ)为0.217,期望杂合度(He)为0.149,平均Nei's遗传距离为0.428.AMOVA分析发现,81％的变异来源于品种内,19％的变异来源于品种间.聚类分析结果表明,在Nei's遗传距离0.24处可将33份菜心分成两大类,第一类包括14个早熟品种、2个中熟和1个晚熟品种;第二类包括10个中晚熟品种和6个早熟品种.[结论]SCoT标记的分类结果与熟期分类结果较一致,多数菜心品种可根据熟期和SCoT标记归类;SCoT标记具有操作简单、重复性高、多态性较丰富等优点,可用于菜心遗传多样性研究的初步批量检测.
[目的]利用SCoT標記分析菜心種質資源的遺傳多樣性,為其分類和利用提供理論依據.[方法]搜集熟期和株色各異的33份菜心種質資源,利用篩選的12條SCoT引物對其進行遺傳多樣性分析.[結果]12條引物從33份菜心共擴增齣83條帶,引物多態性百分率變化範圍為2.63％～57.89％,平均多態性百分率為36.00％;每條引物多態性條帶變化範圍為4～9條,平均3.4條;擴增片段大小為500～1500 bp.觀察等位基因數(Na)為1.065,有效等位基因數(Ne)為1.254,Shannon's信息多樣性指數(Ⅰ)為0.217,期望雜閤度(He)為0.149,平均Nei's遺傳距離為0.428.AMOVA分析髮現,81％的變異來源于品種內,19％的變異來源于品種間.聚類分析結果錶明,在Nei's遺傳距離0.24處可將33份菜心分成兩大類,第一類包括14箇早熟品種、2箇中熟和1箇晚熟品種;第二類包括10箇中晚熟品種和6箇早熟品種.[結論]SCoT標記的分類結果與熟期分類結果較一緻,多數菜心品種可根據熟期和SCoT標記歸類;SCoT標記具有操作簡單、重複性高、多態性較豐富等優點,可用于菜心遺傳多樣性研究的初步批量檢測.
[목적]이용SCoT표기분석채심충질자원적유전다양성,위기분류화이용제공이론의거.[방법]수집숙기화주색각이적33빈채심충질자원,이용사선적12조SCoT인물대기진행유전다양성분석.[결과]12조인물종33빈채심공확증출83조대,인물다태성백분솔변화범위위2.63％～57.89％,평균다태성백분솔위36.00％;매조인물다태성조대변화범위위4～9조,평균3.4조;확증편단대소위500～1500 bp.관찰등위기인수(Na)위1.065,유효등위기인수(Ne)위1.254,Shannon's신식다양성지수(Ⅰ)위0.217,기망잡합도(He)위0.149,평균Nei's유전거리위0.428.AMOVA분석발현,81％적변이래원우품충내,19％적변이래원우품충간.취류분석결과표명,재Nei's유전거리0.24처가장33빈채심분성량대류,제일류포괄14개조숙품충、2개중숙화1개만숙품충;제이류포괄10개중만숙품충화6개조숙품충.[결론]SCoT표기적분류결과여숙기분류결과교일치,다수채심품충가근거숙기화SCoT표기귀류;SCoT표기구유조작간단、중복성고、다태성교봉부등우점,가용우채심유전다양성연구적초보비량검측.
