中国水产科学
中國水產科學
중국수산과학
Journal of Fishery Sciences of China
2015年
6期
1133-1141
,共9页
李献儒%柳淑芳%李达%杜腾飞%庄志猛
李獻儒%柳淑芳%李達%杜騰飛%莊誌猛
리헌유%류숙방%리체%두등비%장지맹
鲱形目%CO Ⅰ基因%DNA条形码%遗传距离%系统进化
鯡形目%CO Ⅰ基因%DNA條形碼%遺傳距離%繫統進化
비형목%CO Ⅰ기인%DNA조형마%유전거리%계통진화
Clupeiformes%CO Ⅰ gene%DNA barcoding%genetic distance%phylogenetic tree
采用PCR特异性扩增获得中国近海鲱形目(Clupeiformes)2科6属7种的48条线粒体CO Ⅰ基因序列,结合从GenBank筛选出的4科40属83种的CO Ⅰ基因序列225条,对鲱形目鱼类的CO Ⅰ条形码基因特征、种内与种间遗传距离及其分子系统进化关系进行了分析,探索了DNA条形码技术在辅助鱼类物种鉴定和分类中的适应性.结果表明,4科41属90种273条CO Ⅰ基因序列的平均碱基组成为T:28.3%、C:28.3%、A:24.2%、G:19.2%,碱基组成表现出明显偏倚性.鲱形目鱼类种间的平均遗传距离为0.131,种内平均遗传距离为0.003,种间距离为种内距离的41倍;系统学分析结果显示,97.8%的鱼类在系统进化树上均为单系.可见,鲱形目鱼类DNA条形码符合物种鉴定的要求,且基于CO Ⅰ基因所建的NJ树对物种分类具有较为准确的辨识力.系统进化分析结果表明,COⅠ基因不仅能够解决低阶分类单元的系统进化关系,对于高阶分类单元的系统分析研究结果也有一定参考价值.
採用PCR特異性擴增穫得中國近海鯡形目(Clupeiformes)2科6屬7種的48條線粒體CO Ⅰ基因序列,結閤從GenBank篩選齣的4科40屬83種的CO Ⅰ基因序列225條,對鯡形目魚類的CO Ⅰ條形碼基因特徵、種內與種間遺傳距離及其分子繫統進化關繫進行瞭分析,探索瞭DNA條形碼技術在輔助魚類物種鑒定和分類中的適應性.結果錶明,4科41屬90種273條CO Ⅰ基因序列的平均堿基組成為T:28.3%、C:28.3%、A:24.2%、G:19.2%,堿基組成錶現齣明顯偏倚性.鯡形目魚類種間的平均遺傳距離為0.131,種內平均遺傳距離為0.003,種間距離為種內距離的41倍;繫統學分析結果顯示,97.8%的魚類在繫統進化樹上均為單繫.可見,鯡形目魚類DNA條形碼符閤物種鑒定的要求,且基于CO Ⅰ基因所建的NJ樹對物種分類具有較為準確的辨識力.繫統進化分析結果錶明,COⅠ基因不僅能夠解決低階分類單元的繫統進化關繫,對于高階分類單元的繫統分析研究結果也有一定參攷價值.
채용PCR특이성확증획득중국근해비형목(Clupeiformes)2과6속7충적48조선립체CO Ⅰ기인서렬,결합종GenBank사선출적4과40속83충적CO Ⅰ기인서렬225조,대비형목어류적CO Ⅰ조형마기인특정、충내여충간유전거리급기분자계통진화관계진행료분석,탐색료DNA조형마기술재보조어류물충감정화분류중적괄응성.결과표명,4과41속90충273조CO Ⅰ기인서렬적평균감기조성위T:28.3%、C:28.3%、A:24.2%、G:19.2%,감기조성표현출명현편의성.비형목어류충간적평균유전거리위0.131,충내평균유전거리위0.003,충간거리위충내거리적41배;계통학분석결과현시,97.8%적어류재계통진화수상균위단계.가견,비형목어류DNA조형마부합물충감정적요구,차기우CO Ⅰ기인소건적NJ수대물충분류구유교위준학적변식력.계통진화분석결과표명,COⅠ기인불부능구해결저계분류단원적계통진화관계,대우고계분류단원적계통분석연구결과야유일정삼고개치.