数据采集与处理
數據採集與處理
수거채집여처리
Journal of Data Acquisition & Processing
2015年
5期
1078-1084
,共7页
基因表达%并行计算%外显子芯片%概率模型
基因錶達%併行計算%外顯子芯片%概率模型
기인표체%병행계산%외현자심편%개솔모형
gene expression%parallel computing%exon chips%probabilistic model
快速准确地计算出转录组表达水平对转录组研究具有重要的作用.本文针对伽玛分布的概率模型(Gamma model for exon array data,GME)在处理大规模外显子芯片数据集上效率低下的特点,提出一种充分利用多核处理机或者集群环境来提高效率的并行计算方法.首先分析GME模型的原理,其次分析模型并行算法的选择,最后在不同规模的数据集上分析并行计算的效率.通过实验验证了并行计算极大地提高了模型的计算效率.实验结果表明,与先前的串行计算相比,并行计算使得GME模型更适用于大规模的外显子芯片分析.
快速準確地計算齣轉錄組錶達水平對轉錄組研究具有重要的作用.本文針對伽瑪分佈的概率模型(Gamma model for exon array data,GME)在處理大規模外顯子芯片數據集上效率低下的特點,提齣一種充分利用多覈處理機或者集群環境來提高效率的併行計算方法.首先分析GME模型的原理,其次分析模型併行算法的選擇,最後在不同規模的數據集上分析併行計算的效率.通過實驗驗證瞭併行計算極大地提高瞭模型的計算效率.實驗結果錶明,與先前的串行計算相比,併行計算使得GME模型更適用于大規模的外顯子芯片分析.
쾌속준학지계산출전록조표체수평대전록조연구구유중요적작용.본문침대가마분포적개솔모형(Gamma model for exon array data,GME)재처리대규모외현자심편수거집상효솔저하적특점,제출일충충분이용다핵처리궤혹자집군배경래제고효솔적병행계산방법.수선분석GME모형적원리,기차분석모형병행산법적선택,최후재불동규모적수거집상분석병행계산적효솔.통과실험험증료병행계산겁대지제고료모형적계산효솔.실험결과표명,여선전적천행계산상비,병행계산사득GME모형경괄용우대규모적외현자심편분석.
