遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2011年
9期
975-981
,共7页
人类肌肉增强因子2%生物信息学%进化%结构域%序列比对
人類肌肉增彊因子2%生物信息學%進化%結構域%序列比對
인류기육증강인자2%생물신식학%진화%결구역%서렬비대
肌肉增强因子2(Myocyte enhancer factor 2,MEF2)是MADS(MCM1,agamous,deficiens和serum response factor)家族成员之一,在动物发育过程中起到重要的调节作用.为了进一步了解其调控的复杂性,本文根据NCBI中已有的人类MEF2相关数据,应用ExPASy在线序列分析工具、CBS在线分析服务器软件、Conserved Domain Database(CDD)数据库、SABLE在线分析软件等对人类MEF2蛋白的不同亚型序列进行比较分析,同时,根据相关序列的比对结果构建系统进化树进行分析.结果表明,MEF2在人体内以多种蛋白形式存在,其理化性质存在一定差别,可能的翻译后糖基化修饰多为O型糖基化且均存在较多磷酸化位点.人类各MEF2蛋白具明显MADS结构域,多数具有MEF2结构域和HJURP_C结构域.各MEF2蛋白二级结构均包括了螺旋、折叠和无规则卷曲等多种形式,其三级结构模式相似.系统进化树显示MEF2B蛋白与其他蛋白有着较大的序列差异及较远进化关系,可能较为原始.
肌肉增彊因子2(Myocyte enhancer factor 2,MEF2)是MADS(MCM1,agamous,deficiens和serum response factor)傢族成員之一,在動物髮育過程中起到重要的調節作用.為瞭進一步瞭解其調控的複雜性,本文根據NCBI中已有的人類MEF2相關數據,應用ExPASy在線序列分析工具、CBS在線分析服務器軟件、Conserved Domain Database(CDD)數據庫、SABLE在線分析軟件等對人類MEF2蛋白的不同亞型序列進行比較分析,同時,根據相關序列的比對結果構建繫統進化樹進行分析.結果錶明,MEF2在人體內以多種蛋白形式存在,其理化性質存在一定差彆,可能的翻譯後糖基化脩飾多為O型糖基化且均存在較多燐痠化位點.人類各MEF2蛋白具明顯MADS結構域,多數具有MEF2結構域和HJURP_C結構域.各MEF2蛋白二級結構均包括瞭螺鏇、摺疊和無規則捲麯等多種形式,其三級結構模式相似.繫統進化樹顯示MEF2B蛋白與其他蛋白有著較大的序列差異及較遠進化關繫,可能較為原始.
기육증강인자2(Myocyte enhancer factor 2,MEF2)시MADS(MCM1,agamous,deficiens화serum response factor)가족성원지일,재동물발육과정중기도중요적조절작용.위료진일보료해기조공적복잡성,본문근거NCBI중이유적인류MEF2상관수거,응용ExPASy재선서렬분석공구、CBS재선분석복무기연건、Conserved Domain Database(CDD)수거고、SABLE재선분석연건등대인류MEF2단백적불동아형서렬진행비교분석,동시,근거상관서렬적비대결과구건계통진화수진행분석.결과표명,MEF2재인체내이다충단백형식존재,기이화성질존재일정차별,가능적번역후당기화수식다위O형당기화차균존재교다린산화위점.인류각MEF2단백구명현MADS결구역,다수구유MEF2결구역화HJURP_C결구역.각MEF2단백이급결구균포괄료라선、절첩화무규칙권곡등다충형식,기삼급결구모식상사.계통진화수현시MEF2B단백여기타단백유착교대적서렬차이급교원진화관계,가능교위원시.
