遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2006年
1期
43-49
,共7页
张凤英%马凌波%乔振国%马春艳
張鳳英%馬凌波%喬振國%馬春豔
장봉영%마릉파%교진국%마춘염
青蟹%细胞色素氧化酶亚基Ⅰ基因%线粒体假基因
青蟹%細胞色素氧化酶亞基Ⅰ基因%線粒體假基因
청해%세포색소양화매아기Ⅰ기인%선립체가기인
线粒体DNA标记在遗传结构和系统进化研究中得到广泛应用,然而核假基因的存在对此有很大威胁.本文以中国东南沿海的青蟹(Scylla paramamosain)为研究对象,利用线粒体COI基因的通用引物和特异性引物进行扩增,分别得到34个假基因(nuclear mitochondrial pseudogenes,Numts)和5个线粒体COI基因序列.在所获得的34个假基因中共定义了29种单倍型,根据序列的相似度,这些假基因可以分为2类,每类假基因都有各自保守的核苷酸序列.第Ⅰ类假基因存在2处插入序列和1处8 bp的缺失序列,这些位点导致了整个阅读框的移位;在第Ⅱ类假基因和5个线粒体COI序列中只有碱基替换,未发现插入和缺失序列.实验结果分析表明,这两类假基因分别代表了2次核整合事件,即核转移事件的最低值.研究结果提示了利用线粒体DNA进行青蟹遗传结构和系统进化研究时应警惕假基因的干扰.
線粒體DNA標記在遺傳結構和繫統進化研究中得到廣汎應用,然而覈假基因的存在對此有很大威脅.本文以中國東南沿海的青蟹(Scylla paramamosain)為研究對象,利用線粒體COI基因的通用引物和特異性引物進行擴增,分彆得到34箇假基因(nuclear mitochondrial pseudogenes,Numts)和5箇線粒體COI基因序列.在所穫得的34箇假基因中共定義瞭29種單倍型,根據序列的相似度,這些假基因可以分為2類,每類假基因都有各自保守的覈苷痠序列.第Ⅰ類假基因存在2處插入序列和1處8 bp的缺失序列,這些位點導緻瞭整箇閱讀框的移位;在第Ⅱ類假基因和5箇線粒體COI序列中隻有堿基替換,未髮現插入和缺失序列.實驗結果分析錶明,這兩類假基因分彆代錶瞭2次覈整閤事件,即覈轉移事件的最低值.研究結果提示瞭利用線粒體DNA進行青蟹遺傳結構和繫統進化研究時應警惕假基因的榦擾.
선립체DNA표기재유전결구화계통진화연구중득도엄범응용,연이핵가기인적존재대차유흔대위협.본문이중국동남연해적청해(Scylla paramamosain)위연구대상,이용선립체COI기인적통용인물화특이성인물진행확증,분별득도34개가기인(nuclear mitochondrial pseudogenes,Numts)화5개선립체COI기인서렬.재소획득적34개가기인중공정의료29충단배형,근거서렬적상사도,저사가기인가이분위2류,매류가기인도유각자보수적핵감산서렬.제Ⅰ류가기인존재2처삽입서렬화1처8 bp적결실서렬,저사위점도치료정개열독광적이위;재제Ⅱ류가기인화5개선립체COI서렬중지유감기체환,미발현삽입화결실서렬.실험결과분석표명,저량류가기인분별대표료2차핵정합사건,즉핵전이사건적최저치.연구결과제시료이용선립체DNA진행청해유전결구화계통진화연구시응경척가기인적간우.
