计算机工程与应用
計算機工程與應用
계산궤공정여응용
COMPUTER ENGINEERING AND APPLICATIONS
2007年
34期
92-94
,共3页
王池社%程家兴%宋杰%苏守宝
王池社%程傢興%宋傑%囌守寶
왕지사%정가흥%송걸%소수보
蛋白质表面%探针球%珠函数
蛋白質錶麵%探針毬%珠函數
단백질표면%탐침구%주함수
蛋白质表面在进行蛋白质相互作用及蛋白质对接等方面有着非常重要的作用.根据蛋白质三维结构数据的特点,首先按照蛋白质的三维几何特征设计了一种提取蛋白质表面原子的几何算法PSAGA.在提取出的表面原子基础上,引用球函数具有的旋转不变性的特点,进行蛋白质表面形状的模拟,模拟出的蛋白质表面可以有效克服蛋白质在空间变换过程中需要不停进行重新计算表面问题,从而有效地提高了计算效率.实验结果验证了所用方法的准确性.
蛋白質錶麵在進行蛋白質相互作用及蛋白質對接等方麵有著非常重要的作用.根據蛋白質三維結構數據的特點,首先按照蛋白質的三維幾何特徵設計瞭一種提取蛋白質錶麵原子的幾何算法PSAGA.在提取齣的錶麵原子基礎上,引用毬函數具有的鏇轉不變性的特點,進行蛋白質錶麵形狀的模擬,模擬齣的蛋白質錶麵可以有效剋服蛋白質在空間變換過程中需要不停進行重新計算錶麵問題,從而有效地提高瞭計算效率.實驗結果驗證瞭所用方法的準確性.
단백질표면재진행단백질상호작용급단백질대접등방면유착비상중요적작용.근거단백질삼유결구수거적특점,수선안조단백질적삼유궤하특정설계료일충제취단백질표면원자적궤하산법PSAGA.재제취출적표면원자기출상,인용구함수구유적선전불변성적특점,진행단백질표면형상적모의,모의출적단백질표면가이유효극복단백질재공간변환과정중수요불정진행중신계산표면문제,종이유효지제고료계산효솔.실험결과험증료소용방법적준학성.
