遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2007年
5期
581-586
,共6页
杨秀芹%刘惠%郭丽娟%许尧%刘娣
楊秀芹%劉惠%郭麗娟%許堯%劉娣
양수근%류혜%곽려연%허요%류제
猪%CAPN1基因%嫩度性状%PCR-SSCP
豬%CAPN1基因%嫩度性狀%PCR-SSCP
저%CAPN1기인%눈도성상%PCR-SSCP
为了进一步研究CAPN1基因变异与肉嫩度的关系,寻找与猪嫩度性状相关的分子标记,对CAPN1基因组进行了克隆、测序,并利用PCR-SSCP方法对其编码区序列进行了分子扫描,寻找多态位点,分析不同基因型在野猪、民猪、大白猪中的种间分布规律.获得了猪CAPN1基因的15个内含子序列;根据GenBank上提供的CAPN1 CDS及克隆的内含子序列设计了5对多态性引物进行PCR-SSCP分析;共找到8个SNPs,其中7个位于外显子上,1个位于内含子上,并且外显子上的突变有3个是错义突变,分别造成了蛋白质多肽链上第54位氨基酸的S/T、第192位氨基酸的G/E、第363位氨基酸的V/I替代;x2独立性检验表明不同基因型在大白猪与野猪、民猪之间存在着极显著的差异(P＜0.01),野猪和民猪之间除了S1引物3种基因型的分布存在显著差异外(0.01＜P＜0.05),其他引物上差异不显著(P＞0.05).这些多态位点具有成为分子标记的潜在可能.
為瞭進一步研究CAPN1基因變異與肉嫩度的關繫,尋找與豬嫩度性狀相關的分子標記,對CAPN1基因組進行瞭剋隆、測序,併利用PCR-SSCP方法對其編碼區序列進行瞭分子掃描,尋找多態位點,分析不同基因型在野豬、民豬、大白豬中的種間分佈規律.穫得瞭豬CAPN1基因的15箇內含子序列;根據GenBank上提供的CAPN1 CDS及剋隆的內含子序列設計瞭5對多態性引物進行PCR-SSCP分析;共找到8箇SNPs,其中7箇位于外顯子上,1箇位于內含子上,併且外顯子上的突變有3箇是錯義突變,分彆造成瞭蛋白質多肽鏈上第54位氨基痠的S/T、第192位氨基痠的G/E、第363位氨基痠的V/I替代;x2獨立性檢驗錶明不同基因型在大白豬與野豬、民豬之間存在著極顯著的差異(P＜0.01),野豬和民豬之間除瞭S1引物3種基因型的分佈存在顯著差異外(0.01＜P＜0.05),其他引物上差異不顯著(P＞0.05).這些多態位點具有成為分子標記的潛在可能.
위료진일보연구CAPN1기인변이여육눈도적관계,심조여저눈도성상상관적분자표기,대CAPN1기인조진행료극륭、측서,병이용PCR-SSCP방법대기편마구서렬진행료분자소묘,심조다태위점,분석불동기인형재야저、민저、대백저중적충간분포규률.획득료저CAPN1기인적15개내함자서렬;근거GenBank상제공적CAPN1 CDS급극륭적내함자서렬설계료5대다태성인물진행PCR-SSCP분석;공조도8개SNPs,기중7개위우외현자상,1개위우내함자상,병차외현자상적돌변유3개시착의돌변,분별조성료단백질다태련상제54위안기산적S/T、제192위안기산적G/E、제363위안기산적V/I체대;x2독립성검험표명불동기인형재대백저여야저、민저지간존재착겁현저적차이(P＜0.01),야저화민저지간제료S1인물3충기인형적분포존재현저차이외(0.01＜P＜0.05),기타인물상차이불현저(P＞0.05).저사다태위점구유성위분자표기적잠재가능.
