遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2005年
4期
629-635
,共7页
孙奕钢%高雷%张忠华%薛庆中
孫奕鋼%高雷%張忠華%薛慶中
손혁강%고뢰%장충화%설경중
Jensen-Shannon离散量%Jensen-Renyi离散量%α-KL离散量%α-Jensen-Shannon离散量%GC含量%编码与非编码区%水稻
Jensen-Shannon離散量%Jensen-Renyi離散量%α-KL離散量%α-Jensen-Shannon離散量%GC含量%編碼與非編碼區%水稻
Jensen-Shannon리산량%Jensen-Renyi리산량%α-KL리산량%α-Jensen-Shannon리산량%GC함량%편마여비편마구%수도
在分析DNA序列复杂度、预测基因编码区和非编码的DNA边界识别等问题中,以熵为基础构造的离散量度量提供了一种强有力的工具.为改进寻找水稻基因编码与非编码区边界的效率,提出了两个新的离散量度量(α-kL离散量与α-Jensen-Shannon离散量),根据密码子的GC含量对氨基酸对应密码子构建了粗粒化向量.比较了融合Jensen-Shannon离散量、Jensen-Renyi离散量、α-KL离散量和α-Jensen-Shannon离散量等不同向量所获得的精度,结果表明,在对水稻基因编码区‘终止子'的识别效率上,构建的密码子粗粒化向量融合新引进的度量方法比Bernaola等人的方法(2000)提高了4～5倍.
在分析DNA序列複雜度、預測基因編碼區和非編碼的DNA邊界識彆等問題中,以熵為基礎構造的離散量度量提供瞭一種彊有力的工具.為改進尋找水稻基因編碼與非編碼區邊界的效率,提齣瞭兩箇新的離散量度量(α-kL離散量與α-Jensen-Shannon離散量),根據密碼子的GC含量對氨基痠對應密碼子構建瞭粗粒化嚮量.比較瞭融閤Jensen-Shannon離散量、Jensen-Renyi離散量、α-KL離散量和α-Jensen-Shannon離散量等不同嚮量所穫得的精度,結果錶明,在對水稻基因編碼區‘終止子'的識彆效率上,構建的密碼子粗粒化嚮量融閤新引進的度量方法比Bernaola等人的方法(2000)提高瞭4～5倍.
재분석DNA서렬복잡도、예측기인편마구화비편마적DNA변계식별등문제중,이적위기출구조적리산량도량제공료일충강유력적공구.위개진심조수도기인편마여비편마구변계적효솔,제출료량개신적리산량도량(α-kL리산량여α-Jensen-Shannon리산량),근거밀마자적GC함량대안기산대응밀마자구건료조립화향량.비교료융합Jensen-Shannon리산량、Jensen-Renyi리산량、α-KL리산량화α-Jensen-Shannon리산량등불동향량소획득적정도,결과표명,재대수도기인편마구‘종지자'적식별효솔상,구건적밀마자조립화향량융합신인진적도량방법비Bernaola등인적방법(2000)제고료4～5배.
