计算机工程与应用
計算機工程與應用
계산궤공정여응용
COMPUTER ENGINEERING AND APPLICATIONS
2008年
10期
98-103
,共6页
张伟%郝江锋%项俊平%胡茂林
張偉%郝江鋒%項俊平%鬍茂林
장위%학강봉%항준평%호무림
统计直方图%蛋白质作用面%概率神经网络%结构比对%分类器
統計直方圖%蛋白質作用麵%概率神經網絡%結構比對%分類器
통계직방도%단백질작용면%개솔신경망락%결구비대%분류기
蛋白质-蛋白质作用面上的结构特征对于研究蛋白质功能具有重要意义.提出了一种新的、基于统计直方图提取蛋白质作用面特征的方法,并且利用提取出的作用面特征,结合概率神经网络,实现了对作用面结构类型的分类预测.从预测结果来看,统计直方图提取出的特征,对蛋白质作用面结构具有很好的区分能力,而且可以通过调节划分的区间个数和节点的选取方式,达到对作用面结构的不同粒度的描述,以适用于不同目的的研究,这可能对与结构有关的某些生物信息学问题的研究具有启发性.利用概率神经网络时作用面结构进行分类预测,避开了费时的结构比对和数据库搜索,且训练快速,扩展能力强,正确率高,时独立测试集的911个蛋白复合物视在正确率达到90.67%.基于该算法的MATLAB分类器软件可以通过E-Mail与作者联系获取.
蛋白質-蛋白質作用麵上的結構特徵對于研究蛋白質功能具有重要意義.提齣瞭一種新的、基于統計直方圖提取蛋白質作用麵特徵的方法,併且利用提取齣的作用麵特徵,結閤概率神經網絡,實現瞭對作用麵結構類型的分類預測.從預測結果來看,統計直方圖提取齣的特徵,對蛋白質作用麵結構具有很好的區分能力,而且可以通過調節劃分的區間箇數和節點的選取方式,達到對作用麵結構的不同粒度的描述,以適用于不同目的的研究,這可能對與結構有關的某些生物信息學問題的研究具有啟髮性.利用概率神經網絡時作用麵結構進行分類預測,避開瞭費時的結構比對和數據庫搜索,且訓練快速,擴展能力彊,正確率高,時獨立測試集的911箇蛋白複閤物視在正確率達到90.67%.基于該算法的MATLAB分類器軟件可以通過E-Mail與作者聯繫穫取.
단백질-단백질작용면상적결구특정대우연구단백질공능구유중요의의.제출료일충신적、기우통계직방도제취단백질작용면특정적방법,병차이용제취출적작용면특정,결합개솔신경망락,실현료대작용면결구류형적분류예측.종예측결과래간,통계직방도제취출적특정,대단백질작용면결구구유흔호적구분능력,이차가이통과조절화분적구간개수화절점적선취방식,체도대작용면결구적불동립도적묘술,이괄용우불동목적적연구,저가능대여결구유관적모사생물신식학문제적연구구유계발성.이용개솔신경망락시작용면결구진행분류예측,피개료비시적결구비대화수거고수색,차훈련쾌속,확전능력강,정학솔고,시독립측시집적911개단백복합물시재정학솔체도90.67%.기우해산법적MATLAB분류기연건가이통과E-Mail여작자련계획취.
