计算机工程与应用
計算機工程與應用
계산궤공정여응용
COMPUTER ENGINEERING AND APPLICATIONS
2011年
9期
4-7
,共4页
蛋白质交互网%功能模块%随机走步
蛋白質交互網%功能模塊%隨機走步
단백질교호망%공능모괴%수궤주보
认定蛋白质交互网中的功能模块对于理解细胞的组织结构,处理过程及其功能都是至关重要的.由于一个蛋白质可能具有多重功能因此蛋白质功能模块可能会相互交叠.然而,目前已有的一些识别功能模块的软聚类算法有如下两个缺陷:一是一些算法需要阈值来截断聚类;二是有些算法需要预设聚类数目.为了克服这两个缺陷,提出了随机走步软聚类识别算法来认定蛋白质交互网中的交叠功能模块.实验结果表明该算法在无需任何参数的情况下能发现一些重要的交叠功能模块.
認定蛋白質交互網中的功能模塊對于理解細胞的組織結構,處理過程及其功能都是至關重要的.由于一箇蛋白質可能具有多重功能因此蛋白質功能模塊可能會相互交疊.然而,目前已有的一些識彆功能模塊的軟聚類算法有如下兩箇缺陷:一是一些算法需要閾值來截斷聚類;二是有些算法需要預設聚類數目.為瞭剋服這兩箇缺陷,提齣瞭隨機走步軟聚類識彆算法來認定蛋白質交互網中的交疊功能模塊.實驗結果錶明該算法在無需任何參數的情況下能髮現一些重要的交疊功能模塊.
인정단백질교호망중적공능모괴대우리해세포적조직결구,처리과정급기공능도시지관중요적.유우일개단백질가능구유다중공능인차단백질공능모괴가능회상호교첩.연이,목전이유적일사식별공능모괴적연취류산법유여하량개결함:일시일사산법수요역치래절단취류;이시유사산법수요예설취류수목.위료극복저량개결함,제출료수궤주보연취류식별산법래인정단백질교호망중적교첩공능모괴.실험결과표명해산법재무수임하삼수적정황하능발현일사중요적교첩공능모괴.
