遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2007年
8期
963-971
,共9页
马志杰%魏雅萍%钟金城%陈智华%卢虹%童子保
馬誌傑%魏雅萍%鐘金城%陳智華%盧虹%童子保
마지걸%위아평%종금성%진지화%로홍%동자보
欧拉型藏绵羊%GHR基因%克隆%微卫星%启动子
歐拉型藏綿羊%GHR基因%剋隆%微衛星%啟動子
구랍형장면양%GHR기인%극륭%미위성%계동자
对欧拉型藏绵羊生长激素受体(GHR)基因5'侧翼区(包括P1启动子和外显子1A)进行了T-A克隆和序列测定(GenBank accession No.EF116490),在分析其序列结构特征的基础上与GenBank中摩弗伦羊、山羊、普通牛、欧洲野牛进行了比较基因组学和系统进化研究,结果表明:(1)欧拉型藏绵羊GHR基因启动子P1区存在C/EBP、C/EBPb、SP1、Cap、USF、HFH-2、HNF-3b、Oct-1等多个潜在的转录因子结合位点,可能与GHR基因的转录调控和起始以及特异表达有关.在该非编码序列中,重复序列所占比率为2.55%,不存在SINEs、LINEs、LTR类反转录元件和DNA转座子元件,而发现存在一(TG)11微卫星位点;(2)在启动子P1区,藏绵羊与摩弗伦羊、山羊、普通牛、欧洲野牛各物种间同源性大小分别为99.7%、94.2%、85.9%、86.5%;而在外显子1A区段,藏绵羊与摩弗伦羊、山羊、普通牛、欧洲野牛各物种间同源性大小分别为99.0%、97.0%、92.7%、94.6%.物种间欧拉型藏绵羊与摩弗伦羊同源性最高,而欧拉型藏绵羊与普通牛最低.(3)邻接法(即NJ法)构建的分子系统进化树聚类结果表明,欧拉型藏绵羊与摩弗伦羊先聚为一类,再与山羊聚类形成一个大分支,而普通牛和欧洲野牛先聚类形成另一大分支,两大分支最后再聚为一起,其聚类结果与线粒体DNA和动物学分类的研究结果一致.
對歐拉型藏綿羊生長激素受體(GHR)基因5'側翼區(包括P1啟動子和外顯子1A)進行瞭T-A剋隆和序列測定(GenBank accession No.EF116490),在分析其序列結構特徵的基礎上與GenBank中摩弗倫羊、山羊、普通牛、歐洲野牛進行瞭比較基因組學和繫統進化研究,結果錶明:(1)歐拉型藏綿羊GHR基因啟動子P1區存在C/EBP、C/EBPb、SP1、Cap、USF、HFH-2、HNF-3b、Oct-1等多箇潛在的轉錄因子結閤位點,可能與GHR基因的轉錄調控和起始以及特異錶達有關.在該非編碼序列中,重複序列所佔比率為2.55%,不存在SINEs、LINEs、LTR類反轉錄元件和DNA轉座子元件,而髮現存在一(TG)11微衛星位點;(2)在啟動子P1區,藏綿羊與摩弗倫羊、山羊、普通牛、歐洲野牛各物種間同源性大小分彆為99.7%、94.2%、85.9%、86.5%;而在外顯子1A區段,藏綿羊與摩弗倫羊、山羊、普通牛、歐洲野牛各物種間同源性大小分彆為99.0%、97.0%、92.7%、94.6%.物種間歐拉型藏綿羊與摩弗倫羊同源性最高,而歐拉型藏綿羊與普通牛最低.(3)鄰接法(即NJ法)構建的分子繫統進化樹聚類結果錶明,歐拉型藏綿羊與摩弗倫羊先聚為一類,再與山羊聚類形成一箇大分支,而普通牛和歐洲野牛先聚類形成另一大分支,兩大分支最後再聚為一起,其聚類結果與線粒體DNA和動物學分類的研究結果一緻.
대구랍형장면양생장격소수체(GHR)기인5'측익구(포괄P1계동자화외현자1A)진행료T-A극륭화서렬측정(GenBank accession No.EF116490),재분석기서렬결구특정적기출상여GenBank중마불륜양、산양、보통우、구주야우진행료비교기인조학화계통진화연구,결과표명:(1)구랍형장면양GHR기인계동자P1구존재C/EBP、C/EBPb、SP1、Cap、USF、HFH-2、HNF-3b、Oct-1등다개잠재적전록인자결합위점,가능여GHR기인적전록조공화기시이급특이표체유관.재해비편마서렬중,중복서렬소점비솔위2.55%,불존재SINEs、LINEs、LTR류반전록원건화DNA전좌자원건,이발현존재일(TG)11미위성위점;(2)재계동자P1구,장면양여마불륜양、산양、보통우、구주야우각물충간동원성대소분별위99.7%、94.2%、85.9%、86.5%;이재외현자1A구단,장면양여마불륜양、산양、보통우、구주야우각물충간동원성대소분별위99.0%、97.0%、92.7%、94.6%.물충간구랍형장면양여마불륜양동원성최고,이구랍형장면양여보통우최저.(3)린접법(즉NJ법)구건적분자계통진화수취류결과표명,구랍형장면양여마불륜양선취위일류,재여산양취류형성일개대분지,이보통우화구주야우선취류형성령일대분지,량대분지최후재취위일기,기취류결과여선립체DNA화동물학분류적연구결과일치.