CAJ | 학술논문

简单重复序列广泛分布于从原核到真核生物的基因组中,其形成的分子机理目前尚不明确.对NCBI数据库中已有256种哺乳动物线粒体DNA(mtDNA)D-loop区进行序列比对分析,根据其所含有的简单重复序列类型分为3组,分别是53种哺乳动物含有六核苷酸重复序列;104种哺乳动物含有非六核苷酸重复序列(>6bp);99种哺乳动物不含有任何重复序列.通过碱基序列分析比对,发现六核苷酸重复序列集中分布在CSB1-CSB2间隔区,而非六核苷酸重复可以分布于终止区(TAS)、中央保守(Central domain)以及CSB(Central sequence block)区.通过比较含有重复序列与不含重复序列的功能保守区发现,简单重复序列的存在并不明确影响D-loop区内的中央保守区以及CSB1、CSB2、CSB3三个功能保守区的碱基序列保守性.在此基础上,利用N-J法构建了256种哺乳动物的进化树,分析了哺乳动物D-Loop区内重复序列在进化过程中的可能变化规律,发现简单重复序列随着物种的进化地位的升高而呈现消失趋势.
간단중복서렬엄범분포우종원핵도진핵생물적기인조중,기형성적분자궤리목전상불명학.대NCBI수거고중이유256충포유동물선립체DNA(mtDNA)D-loop구진행서렬비대분석,근거기소함유적간단중복서렬류형분위3조,분별시53충포유동물함유륙핵감산중복서렬;104충포유동물함유비륙핵감산중복서렬(>6bp);99충포유동물불함유임하중복서렬.통과감기서렬분석비대,발현륙핵감산중복서렬집중분포재CSB1-CSB2간격구,이비륙핵감산중복가이분포우종지구(TAS)、중앙보수(Central domain)이급CSB(Central sequence block)구.통과비교함유중복서렬여불함중복서렬적공능보수구발현,간단중복서렬적존재병불명학영향D-loop구내적중앙보수구이급CSB1、CSB2、CSB3삼개공능보수구적감기서렬보수성.재차기출상,이용N-J법구건료256충포유동물적진화수,분석료포유동물D-Loop구내중복서렬재진화과정중적가능변화규률,발현간단중복서렬수착물충적진화지위적승고이정현소실추세.