遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2010年
10期
1071-1076
,共6页
黄关青%华玉伟%高战%黄华孙
黃關青%華玉偉%高戰%黃華孫
황관청%화옥위%고전%황화손
巴西橡胶树%甲基化过滤%基因富集%文库构建
巴西橡膠樹%甲基化過濾%基因富集%文庫構建
파서상효수%갑기화과려%기인부집%문고구건
为高通量富集橡胶树基因编码序列,文章首次利用大肠杆菌McrBC限制修饰系统构建了巴西橡胶树基因组甲基化过滤文库.该文库未扩增和扩增后的滴度分别为2.6×106pfu/mL和9×109pfu/mL,阳性克隆率为86.4%,插入片段大小为1～2.5 kb,平均长度为1.2 kb.随机挑选100个克隆进行测序,共拼接出81个非冗余序列,其中包括6个重叠群(Contigs)和75个单一序列(Singlets),冗余度为17.35%.Blast分析发现,39.5%非冗余序列与Nr库中功能基因同源,14.81%与EST数据库中序列同源,32.1%序列为未知序列,且部分序列为开花调控、抗虫和抗病等功能相关的同源基因.橡胶树甲基化文库的建立为橡胶树重要功能基因发现和克隆提供一条重要途径.
為高通量富集橡膠樹基因編碼序列,文章首次利用大腸桿菌McrBC限製脩飾繫統構建瞭巴西橡膠樹基因組甲基化過濾文庫.該文庫未擴增和擴增後的滴度分彆為2.6×106pfu/mL和9×109pfu/mL,暘性剋隆率為86.4%,插入片段大小為1～2.5 kb,平均長度為1.2 kb.隨機挑選100箇剋隆進行測序,共拼接齣81箇非冗餘序列,其中包括6箇重疊群(Contigs)和75箇單一序列(Singlets),冗餘度為17.35%.Blast分析髮現,39.5%非冗餘序列與Nr庫中功能基因同源,14.81%與EST數據庫中序列同源,32.1%序列為未知序列,且部分序列為開花調控、抗蟲和抗病等功能相關的同源基因.橡膠樹甲基化文庫的建立為橡膠樹重要功能基因髮現和剋隆提供一條重要途徑.
위고통량부집상효수기인편마서렬,문장수차이용대장간균McrBC한제수식계통구건료파서상효수기인조갑기화과려문고.해문고미확증화확증후적적도분별위2.6×106pfu/mL화9×109pfu/mL,양성극륭솔위86.4%,삽입편단대소위1～2.5 kb,평균장도위1.2 kb.수궤도선100개극륭진행측서,공병접출81개비용여서렬,기중포괄6개중첩군(Contigs)화75개단일서렬(Singlets),용여도위17.35%.Blast분석발현,39.5%비용여서렬여Nr고중공능기인동원,14.81%여EST수거고중서렬동원,32.1%서렬위미지서렬,차부분서렬위개화조공、항충화항병등공능상관적동원기인.상효수갑기화문고적건립위상효수중요공능기인발현화극륭제공일조중요도경.
