计算机工程与应用
計算機工程與應用
계산궤공정여응용
COMPUTER ENGINEERING AND APPLICATIONS
2013年
20期
52-54,90
,共4页
Gillespie算法%随机Petri网%生化网络
Gillespie算法%隨機Petri網%生化網絡
Gillespie산법%수궤Petri망%생화망락
Gillespie algorithm%stochastic Petri nets%biochemical network
Petri网既有严格的数学表达方式，又有直观的图形描述形式，是当前生物化学系统模拟和定性分析的一个有力工具。作为标准Petri网的一个重要扩展，随机Petri网使得可以定量地分析生物化学系统。建立了两个典型的生物化学系统的随机Petri网模型：Schlogl系统和转录调控系统，并使用Gillespie随机仿真算法模拟了这些生化随机Petri网模型的状态演化。
Petri網既有嚴格的數學錶達方式，又有直觀的圖形描述形式，是噹前生物化學繫統模擬和定性分析的一箇有力工具。作為標準Petri網的一箇重要擴展，隨機Petri網使得可以定量地分析生物化學繫統。建立瞭兩箇典型的生物化學繫統的隨機Petri網模型：Schlogl繫統和轉錄調控繫統，併使用Gillespie隨機倣真算法模擬瞭這些生化隨機Petri網模型的狀態縯化。
Petri망기유엄격적수학표체방식，우유직관적도형묘술형식，시당전생물화학계통모의화정성분석적일개유력공구。작위표준Petri망적일개중요확전，수궤Petri망사득가이정량지분석생물화학계통。건립료량개전형적생물화학계통적수궤Petri망모형：Schlogl계통화전록조공계통，병사용Gillespie수궤방진산법모의료저사생화수궤Petri망모형적상태연화。
Petri nets have rigorous mathematical formulation and intuitive graphical expression. It is a powerful tool for the bio-chemical system simulation and qualitative analysis. As an important extension of standard Petri nets, stochastic Petri nets allow it to quantitatively analyze the state of biochemical systems. It establishes biochemical stochastic Petri net models for the follow-ing systems:Schlogl system and transcriptional regulation system, then uses the Gillespie algorithm, it simulates the evolution of the state of these biochemical stochastic Petri net models.
