遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2013年
8期
955-970
,共16页
刘红亮%郑丽明%刘青青%权富生%张涌
劉紅亮%鄭麗明%劉青青%權富生%張湧
류홍량%정려명%류청청%권부생%장용
转录组%非模式生物%RNA-seq
轉錄組%非模式生物%RNA-seq
전록조%비모식생물%RNA-seq
transcriptome%non-model organism%RNA-seq
转录组代表细胞或组织内全部的RNA转录本(RNA transcripts),反映不同生命阶段、不同组织类型、不同生理状态以及不同环境条件下表达的基因.转录组研究可以从整体水平上反映细胞中基因表达情况及其调控规律.非模式生物(Non-model organism)具有许多模式生物不具备的特征,其转录组研究对解决基因进化、遗传育种以及生态等诸多方面的问题具有重要意义.但由于非模式生物缺乏参考基因组信息,传统的转录组研究方法操作复杂,实验周期长,花费大,使得其转录组研究进展缓慢.新一代高通量RNA测序技术(RNA-seq)完全改变了转录组学的研究模式,迅速成为研究非模式生物转录组的先进技术.文章详细论述了近年来利用RNA-seq技术进行非模式生物转录组研究的进展情况,从样品准备、高通量DNA测序以及生物信息学分析等方面介绍了利用RNA-seq技术研究非模式生物转录组的一般流程及方法,并对其中有待进一步研究的问题进行了展望.
轉錄組代錶細胞或組織內全部的RNA轉錄本(RNA transcripts),反映不同生命階段、不同組織類型、不同生理狀態以及不同環境條件下錶達的基因.轉錄組研究可以從整體水平上反映細胞中基因錶達情況及其調控規律.非模式生物(Non-model organism)具有許多模式生物不具備的特徵,其轉錄組研究對解決基因進化、遺傳育種以及生態等諸多方麵的問題具有重要意義.但由于非模式生物缺乏參攷基因組信息,傳統的轉錄組研究方法操作複雜,實驗週期長,花費大,使得其轉錄組研究進展緩慢.新一代高通量RNA測序技術(RNA-seq)完全改變瞭轉錄組學的研究模式,迅速成為研究非模式生物轉錄組的先進技術.文章詳細論述瞭近年來利用RNA-seq技術進行非模式生物轉錄組研究的進展情況,從樣品準備、高通量DNA測序以及生物信息學分析等方麵介紹瞭利用RNA-seq技術研究非模式生物轉錄組的一般流程及方法,併對其中有待進一步研究的問題進行瞭展望.
전록조대표세포혹조직내전부적RNA전록본(RNA transcripts),반영불동생명계단、불동조직류형、불동생리상태이급불동배경조건하표체적기인.전록조연구가이종정체수평상반영세포중기인표체정황급기조공규률.비모식생물(Non-model organism)구유허다모식생물불구비적특정,기전록조연구대해결기인진화、유전육충이급생태등제다방면적문제구유중요의의.단유우비모식생물결핍삼고기인조신식,전통적전록조연구방법조작복잡,실험주기장,화비대,사득기전록조연구진전완만.신일대고통량RNA측서기술(RNA-seq)완전개변료전록조학적연구모식,신속성위연구비모식생물전록조적선진기술.문장상세논술료근년래이용RNA-seq기술진행비모식생물전록조연구적진전정황,종양품준비、고통량DNA측서이급생물신식학분석등방면개소료이용RNA-seq기술연구비모식생물전록조적일반류정급방법,병대기중유대진일보연구적문제진행료전망.