遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2013年
10期
1198-1208
,共11页
陈志强%韩新焕%魏钦俊%邢光前%曹新
陳誌彊%韓新煥%魏欽俊%邢光前%曹新
진지강%한신환%위흠준%형광전%조신
内耳发育%转录因子%调控网络
內耳髮育%轉錄因子%調控網絡
내이발육%전록인자%조공망락
inner ear development%transcription factors%regulation network
在脊椎动物内耳发育中,Six1、Six4、Pax2、Pax8、Foxi1、Dlx5、Gbx2、Irx2/3、Msx1等基因作为该心调控基因参与听基板的诱导过程.文章通过生物信息学方法,对小鼠内耳发育的核心转录因子进行保守性分析并研究其相互调控关系,得到小鼠内耳发育过程中核心转录因子的基因调控网络.与文献中已知的小鼠内耳发育基因调控关系相比,Pax2、Pax8、Foxi1、Dlx5基因在内耳发育中仍然起主要调控者的角色,Six1则处于被多个转录因子调节的地位,Gbx2、Irx2/3、Msx1在调控网络中也起到重要作用.对出现的差异进行了合理的分析,同时结合构建的调控网络预测了可能存在的Msx1对Six1、Gbx2的调控作用.序列预测结果也发现了一些新的调控关系,所涉及的转录因子包括Sox5、Lhx2、Rax、Otx1、Otx2、Pitx1、Pitx2、Nkx2-5、Irx4、Irx6、Dlx2、Hmx 1/2/3、Pou4f3、Pax4、Tlx2.文章为深入了解内耳发育调控机制提供了基础信息.
在脊椎動物內耳髮育中,Six1、Six4、Pax2、Pax8、Foxi1、Dlx5、Gbx2、Irx2/3、Msx1等基因作為該心調控基因參與聽基闆的誘導過程.文章通過生物信息學方法,對小鼠內耳髮育的覈心轉錄因子進行保守性分析併研究其相互調控關繫,得到小鼠內耳髮育過程中覈心轉錄因子的基因調控網絡.與文獻中已知的小鼠內耳髮育基因調控關繫相比,Pax2、Pax8、Foxi1、Dlx5基因在內耳髮育中仍然起主要調控者的角色,Six1則處于被多箇轉錄因子調節的地位,Gbx2、Irx2/3、Msx1在調控網絡中也起到重要作用.對齣現的差異進行瞭閤理的分析,同時結閤構建的調控網絡預測瞭可能存在的Msx1對Six1、Gbx2的調控作用.序列預測結果也髮現瞭一些新的調控關繫,所涉及的轉錄因子包括Sox5、Lhx2、Rax、Otx1、Otx2、Pitx1、Pitx2、Nkx2-5、Irx4、Irx6、Dlx2、Hmx 1/2/3、Pou4f3、Pax4、Tlx2.文章為深入瞭解內耳髮育調控機製提供瞭基礎信息.
재척추동물내이발육중,Six1、Six4、Pax2、Pax8、Foxi1、Dlx5、Gbx2、Irx2/3、Msx1등기인작위해심조공기인삼여은기판적유도과정.문장통과생물신식학방법,대소서내이발육적핵심전록인자진행보수성분석병연구기상호조공관계,득도소서내이발육과정중핵심전록인자적기인조공망락.여문헌중이지적소서내이발육기인조공관계상비,Pax2、Pax8、Foxi1、Dlx5기인재내이발육중잉연기주요조공자적각색,Six1칙처우피다개전록인자조절적지위,Gbx2、Irx2/3、Msx1재조공망락중야기도중요작용.대출현적차이진행료합리적분석,동시결합구건적조공망락예측료가능존재적Msx1대Six1、Gbx2적조공작용.서렬예측결과야발현료일사신적조공관계,소섭급적전록인자포괄Sox5、Lhx2、Rax、Otx1、Otx2、Pitx1、Pitx2、Nkx2-5、Irx4、Irx6、Dlx2、Hmx 1/2/3、Pou4f3、Pax4、Tlx2.문장위심입료해내이발육조공궤제제공료기출신식.
