遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2014年
3期
256-275
,共20页
下一代测序技术%表观遗传学%DNA甲基化%组蛋白修饰%染色质构象捕获
下一代測序技術%錶觀遺傳學%DNA甲基化%組蛋白脩飾%染色質構象捕穫
하일대측서기술%표관유전학%DNA갑기화%조단백수식%염색질구상포획
next generation sequencing%epigenetics%DNA methylation%histone modifications%chromosome conformation capture
下一代测序技术(Next generation sequencing,NGS)的出现,极大地促进了表观遗传学的研究.将NGS技术引入表观遗传学,便形成了以NGS为基础的各种表观遗传学测序及研究方法,如:全基因组亚硫酸氢盐测序法(Whole genome bisulfite sequencing,WGBS)、简化代表性亚硫酸氢盐测序法(Reduced representation bisulfite sequencing,RRBS)、甲基化DNA免疫共沉淀测序(Methylated DNA immunoprecipitationsequencing,MeDIP-seq)、染色质免疫共沉淀测序(Chromatin immunoprecipitation-sequencing,ChIP-seq)、Tet辅助重亚硫酸盐测序法(Tet-assisted bisulfite sequencing,TAB-seq)、各种染色体构象捕获测序(Chromosome conformation capture sequencing,3C-seq)技术、Dnase Ⅰ-seq/MNase-seq/FAIRE-seq以及RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq).这些方法的应用和普及改变了人们对多种表观遗传现象的传统认识,使研究人员能够更加全面地深入了解各种表观遗传标志在机体内的广泛分布,以及如何在外界因素的影响下发生相应的动态变化.文章概述了当今主要商业NGS平台的原理和特点,系统介绍了以NGS方法为基础衍生出来的各种表观遗传学测序及研究方法,并在此基础上对近年来应用NGS技术在表观遗传学研究领域中取得的最新研究成果进行了综述.
下一代測序技術(Next generation sequencing,NGS)的齣現,極大地促進瞭錶觀遺傳學的研究.將NGS技術引入錶觀遺傳學,便形成瞭以NGS為基礎的各種錶觀遺傳學測序及研究方法,如:全基因組亞硫痠氫鹽測序法(Whole genome bisulfite sequencing,WGBS)、簡化代錶性亞硫痠氫鹽測序法(Reduced representation bisulfite sequencing,RRBS)、甲基化DNA免疫共沉澱測序(Methylated DNA immunoprecipitationsequencing,MeDIP-seq)、染色質免疫共沉澱測序(Chromatin immunoprecipitation-sequencing,ChIP-seq)、Tet輔助重亞硫痠鹽測序法(Tet-assisted bisulfite sequencing,TAB-seq)、各種染色體構象捕穫測序(Chromosome conformation capture sequencing,3C-seq)技術、Dnase Ⅰ-seq/MNase-seq/FAIRE-seq以及RNA測序(RNA sequencing,RNA-seq).這些方法的應用和普及改變瞭人們對多種錶觀遺傳現象的傳統認識,使研究人員能夠更加全麵地深入瞭解各種錶觀遺傳標誌在機體內的廣汎分佈,以及如何在外界因素的影響下髮生相應的動態變化.文章概述瞭噹今主要商業NGS平檯的原理和特點,繫統介紹瞭以NGS方法為基礎衍生齣來的各種錶觀遺傳學測序及研究方法,併在此基礎上對近年來應用NGS技術在錶觀遺傳學研究領域中取得的最新研究成果進行瞭綜述.
하일대측서기술(Next generation sequencing,NGS)적출현,겁대지촉진료표관유전학적연구.장NGS기술인입표관유전학,편형성료이NGS위기출적각충표관유전학측서급연구방법,여:전기인조아류산경염측서법(Whole genome bisulfite sequencing,WGBS)、간화대표성아류산경염측서법(Reduced representation bisulfite sequencing,RRBS)、갑기화DNA면역공침정측서(Methylated DNA immunoprecipitationsequencing,MeDIP-seq)、염색질면역공침정측서(Chromatin immunoprecipitation-sequencing,ChIP-seq)、Tet보조중아류산염측서법(Tet-assisted bisulfite sequencing,TAB-seq)、각충염색체구상포획측서(Chromosome conformation capture sequencing,3C-seq)기술、Dnase Ⅰ-seq/MNase-seq/FAIRE-seq이급RNA측서(RNA sequencing,RNA-seq).저사방법적응용화보급개변료인문대다충표관유전현상적전통인식,사연구인원능구경가전면지심입료해각충표관유전표지재궤체내적엄범분포,이급여하재외계인소적영향하발생상응적동태변화.문장개술료당금주요상업NGS평태적원리화특점,계통개소료이NGS방법위기출연생출래적각충표관유전학측서급연구방법,병재차기출상대근년래응용NGS기술재표관유전학연구영역중취득적최신연구성과진행료종술.
