遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2014年
8期
779-785
,共7页
李彩霞%贾竟%魏以梁%万立华%胡兰%叶健
李綵霞%賈竟%魏以樑%萬立華%鬍蘭%葉健
리채하%가경%위이량%만립화%호란%협건
分子遗传学%SNP复合检测体系%AIMs%祖先来源推断
分子遺傳學%SNP複閤檢測體繫%AIMs%祖先來源推斷
분자유전학%SNP복합검측체계%AIMs%조선래원추단
molecular genetics%SNP multiplex system%AIMs%ancestry inference
使用一组祖先信息SNPs位点(Ancestry informative markers,AIMs)可以分析某人群的遗传成分构成,推断某个体的祖先来源.文章以HapMap数据库9个人群658份样本的分型数据为基础,从30个表型相关基因的282个SNPs位点中筛选出30个AIMs位点,基于微测序-通用芯片技术构建复合检测体系,建立人群等位基因频率数据库,用于东亚、欧洲和非洲人群遗传成分描述及个体种族来源推断.使用这组位点分析HapMap数据库中658份人群样本,初步验证位点的区分效能;使用构建的体系检验5个人群194份无关个体的DNA样本;通过Structure软件分析获取人群的成分构成以及个体的遗传成分,对个体样本进行种族来源推断.结果表明:筛选的30个AIMs位点符合哈迪温伯格平衡(P＞0.01),位点之间没有连锁(r2＜0.1),658份HapMap数据库样本和194份实验样本的祖先成分分析结果与已知结果完全一致.文章筛选并建立的30个AIMs位点复合检测体系能够有效地实现东亚、欧洲、非洲人群及其混合人群的成分构成和个体遗传成分的分析,该体系可以用于法医DNA检验中个体祖先的来源推断.
使用一組祖先信息SNPs位點(Ancestry informative markers,AIMs)可以分析某人群的遺傳成分構成,推斷某箇體的祖先來源.文章以HapMap數據庫9箇人群658份樣本的分型數據為基礎,從30箇錶型相關基因的282箇SNPs位點中篩選齣30箇AIMs位點,基于微測序-通用芯片技術構建複閤檢測體繫,建立人群等位基因頻率數據庫,用于東亞、歐洲和非洲人群遺傳成分描述及箇體種族來源推斷.使用這組位點分析HapMap數據庫中658份人群樣本,初步驗證位點的區分效能;使用構建的體繫檢驗5箇人群194份無關箇體的DNA樣本;通過Structure軟件分析穫取人群的成分構成以及箇體的遺傳成分,對箇體樣本進行種族來源推斷.結果錶明:篩選的30箇AIMs位點符閤哈迪溫伯格平衡(P＞0.01),位點之間沒有連鎖(r2＜0.1),658份HapMap數據庫樣本和194份實驗樣本的祖先成分分析結果與已知結果完全一緻.文章篩選併建立的30箇AIMs位點複閤檢測體繫能夠有效地實現東亞、歐洲、非洲人群及其混閤人群的成分構成和箇體遺傳成分的分析,該體繫可以用于法醫DNA檢驗中箇體祖先的來源推斷.
사용일조조선신식SNPs위점(Ancestry informative markers,AIMs)가이분석모인군적유전성분구성,추단모개체적조선래원.문장이HapMap수거고9개인군658빈양본적분형수거위기출,종30개표형상관기인적282개SNPs위점중사선출30개AIMs위점,기우미측서-통용심편기술구건복합검측체계,건립인군등위기인빈솔수거고,용우동아、구주화비주인군유전성분묘술급개체충족래원추단.사용저조위점분석HapMap수거고중658빈인군양본,초보험증위점적구분효능;사용구건적체계검험5개인군194빈무관개체적DNA양본;통과Structure연건분석획취인군적성분구성이급개체적유전성분,대개체양본진행충족래원추단.결과표명:사선적30개AIMs위점부합합적온백격평형(P＞0.01),위점지간몰유련쇄(r2＜0.1),658빈HapMap수거고양본화194빈실험양본적조선성분분석결과여이지결과완전일치.문장사선병건립적30개AIMs위점복합검측체계능구유효지실현동아、구주、비주인군급기혼합인군적성분구성화개체유전성분적분석,해체계가이용우법의DNA검험중개체조선적래원추단.
