遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2013年
12期
1391-1402
,共12页
金逍逍%孙悦娜%王日昕%汤达%赵盛龙%徐田军
金逍逍%孫悅娜%王日昕%湯達%趙盛龍%徐田軍
금소소%손열나%왕일흔%탕체%조성룡%서전군
虾虎鱼类%线粒体基因组%结构特征%系统发育基因组学
蝦虎魚類%線粒體基因組%結構特徵%繫統髮育基因組學
하호어류%선립체기인조%결구특정%계통발육기인조학
Gobies%mitochondrial genome%structure characteristic%phylogenomic analysis
虾虎鱼类体态变异大、体型小、种类多,形态鉴定及谱系分类较为困难.为深入开展虾虎鱼类的鉴定、分类及遗传进化等研究,文章对已获得的26种虾虎鱼线粒体全基因组进行分析.结果发现,虾虎鱼类线粒体基因组的基因组成及排列模式与大多数脊椎动物线粒体基因组特征基本一致;由于不同物种的控制区存在不同数量的重复序列而导致基因组序列长度存在明显的差异;26种虾虎鱼线粒体全基因组序列及不同基因中A+T的含量均超过50％,并存在碱基G偏倚现象.基于37个编码基因序列,利用Kimura双参数法计算遗传距离,发现矛尾刺虾虎鱼与斑尾刺虾虎鱼、斑纹舌虾虎鱼与钝吻舌虾虎鱼分别为同种异名.通过对26种虾虎鱼线粒体基因组控制区序列的比较,识别了终止结合序列区、中央保守区及保守序列区.利用26种虾虎鱼线粒体基因组的36个编码基因序列构建系统发育树,发现部分聚类结果不同于传统的形态学分类方式,虾虎鱼科中的5个亚科出现了明显的分化,近盲虾虎鱼亚科、背眼虾虎鱼亚科、瓢虾虎鱼亚科亲缘关系较近而聚成一大支,然后与拟虾虎鱼亚科种类形成姐妹类群,虾虎鱼亚科与其它的4个亚科亲缘关系较远,单独成为一个类群.根据分子钟估算结果推测虾虎鱼科物种可能起源于始新世晚期至渐新世时段,在中新世进一步分化为具有现代表征的虾虎鱼种类.
蝦虎魚類體態變異大、體型小、種類多,形態鑒定及譜繫分類較為睏難.為深入開展蝦虎魚類的鑒定、分類及遺傳進化等研究,文章對已穫得的26種蝦虎魚線粒體全基因組進行分析.結果髮現,蝦虎魚類線粒體基因組的基因組成及排列模式與大多數脊椎動物線粒體基因組特徵基本一緻;由于不同物種的控製區存在不同數量的重複序列而導緻基因組序列長度存在明顯的差異;26種蝦虎魚線粒體全基因組序列及不同基因中A+T的含量均超過50％,併存在堿基G偏倚現象.基于37箇編碼基因序列,利用Kimura雙參數法計算遺傳距離,髮現矛尾刺蝦虎魚與斑尾刺蝦虎魚、斑紋舌蝦虎魚與鈍吻舌蝦虎魚分彆為同種異名.通過對26種蝦虎魚線粒體基因組控製區序列的比較,識彆瞭終止結閤序列區、中央保守區及保守序列區.利用26種蝦虎魚線粒體基因組的36箇編碼基因序列構建繫統髮育樹,髮現部分聚類結果不同于傳統的形態學分類方式,蝦虎魚科中的5箇亞科齣現瞭明顯的分化,近盲蝦虎魚亞科、揹眼蝦虎魚亞科、瓢蝦虎魚亞科親緣關繫較近而聚成一大支,然後與擬蝦虎魚亞科種類形成姐妹類群,蝦虎魚亞科與其它的4箇亞科親緣關繫較遠,單獨成為一箇類群.根據分子鐘估算結果推測蝦虎魚科物種可能起源于始新世晚期至漸新世時段,在中新世進一步分化為具有現代錶徵的蝦虎魚種類.
하호어류체태변이대、체형소、충류다,형태감정급보계분류교위곤난.위심입개전하호어류적감정、분류급유전진화등연구,문장대이획득적26충하호어선립체전기인조진행분석.결과발현,하호어류선립체기인조적기인조성급배렬모식여대다수척추동물선립체기인조특정기본일치;유우불동물충적공제구존재불동수량적중복서렬이도치기인조서렬장도존재명현적차이;26충하호어선립체전기인조서렬급불동기인중A+T적함량균초과50％,병존재감기G편의현상.기우37개편마기인서렬,이용Kimura쌍삼수법계산유전거리,발현모미자하호어여반미자하호어、반문설하호어여둔문설하호어분별위동충이명.통과대26충하호어선립체기인조공제구서렬적비교,식별료종지결합서렬구、중앙보수구급보수서렬구.이용26충하호어선립체기인조적36개편마기인서렬구건계통발육수,발현부분취류결과불동우전통적형태학분류방식,하호어과중적5개아과출현료명현적분화,근맹하호어아과、배안하호어아과、표하호어아과친연관계교근이취성일대지,연후여의하호어아과충류형성저매류군,하호어아과여기타적4개아과친연관계교원,단독성위일개류군.근거분자종고산결과추측하호어과물충가능기원우시신세만기지점신세시단,재중신세진일보분화위구유현대표정적하호어충류.
