遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2011年
7期
785-793
,共9页
周晓罡%侯思名%陈铎文%陶南%丁玉梅%孙茂林%张绍松
週曉罡%侯思名%陳鐸文%陶南%丁玉梅%孫茂林%張紹鬆
주효강%후사명%진탁문%도남%정옥매%손무림%장소송
晚疫病菌%信号肽%分泌蛋白
晚疫病菌%信號肽%分泌蛋白
만역병균%신호태%분비단백
利用马铃薯晚疫病菌全基因组测序结果,结合计算机技术和生物信息学的方法,对马铃薯晚疫病菌的蛋白进行分析,为明确该病原菌与寄主互作的分子机制奠定基础.文章应用信号肽预测软件SignaIP v3.0和PSORT,跨膜螺旋结构预测软件TMHMM-2.0和THUMBUP,GPI锚定位点预测软件big-PI Predictor,亚细胞器中蛋白定位分布预测软件TargetP v1.01,对已经公布的马铃薯晚疫病菌全基因组22 658个蛋白质氨基酸序列进行分析.结果发现,晚疫病菌全基因组编码蛋白中有671个为潜在的分泌型蛋白,占编码蛋白总数的3.0%.其中有45个分泌蛋白有功能方面的描述,其功能涉及细胞代谢、信号转导等方面;此外,还有一些与激发子类似的分泌蛋白,它们可能与晚疫病菌的毒性有关.
利用馬鈴藷晚疫病菌全基因組測序結果,結閤計算機技術和生物信息學的方法,對馬鈴藷晚疫病菌的蛋白進行分析,為明確該病原菌與寄主互作的分子機製奠定基礎.文章應用信號肽預測軟件SignaIP v3.0和PSORT,跨膜螺鏇結構預測軟件TMHMM-2.0和THUMBUP,GPI錨定位點預測軟件big-PI Predictor,亞細胞器中蛋白定位分佈預測軟件TargetP v1.01,對已經公佈的馬鈴藷晚疫病菌全基因組22 658箇蛋白質氨基痠序列進行分析.結果髮現,晚疫病菌全基因組編碼蛋白中有671箇為潛在的分泌型蛋白,佔編碼蛋白總數的3.0%.其中有45箇分泌蛋白有功能方麵的描述,其功能涉及細胞代謝、信號轉導等方麵;此外,還有一些與激髮子類似的分泌蛋白,它們可能與晚疫病菌的毒性有關.
이용마령서만역병균전기인조측서결과,결합계산궤기술화생물신식학적방법,대마령서만역병균적단백진행분석,위명학해병원균여기주호작적분자궤제전정기출.문장응용신호태예측연건SignaIP v3.0화PSORT,과막라선결구예측연건TMHMM-2.0화THUMBUP,GPI묘정위점예측연건big-PI Predictor,아세포기중단백정위분포예측연건TargetP v1.01,대이경공포적마령서만역병균전기인조22 658개단백질안기산서렬진행분석.결과발현,만역병균전기인조편마단백중유671개위잠재적분비형단백,점편마단백총수적3.0%.기중유45개분비단백유공능방면적묘술,기공능섭급세포대사、신호전도등방면;차외,환유일사여격발자유사적분비단백,타문가능여만역병균적독성유관.
