遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2014年
2期
152-168
,共17页
WRKY%蒺藜苜蓿%基因重复%系统进化%EST表达模式
WRKY%蒺藜苜蓿%基因重複%繫統進化%EST錶達模式
WRKY%질려목숙%기인중복%계통진화%EST표체모식
WRKY%Medicago truncatula%gene duplication%phylogenetic analysis%EST expression profile
WRKY基因家族是植物基因组内一类重要的转录因子,参与植物许多生理生化过程,如植物发育、代谢以及生物和非生物胁迫.目前,已在多种植物中鉴定出WRKY基因家族,但是关于蒺藜苜蓿(Medicago truncatula L.) WRKY基因家族的系统分析鲜有报道.文章利用生物信息学方法,从蒺藜苜蓿全基因组中共鉴定出93个WRKY基因,包括81个标准的WRKY基因(19个Ⅰ型基因,49个Ⅱ型基因以及13个Ⅲ型基因)和12个非标准类型的WRKy基因.对这些WRKY基因进行了基因重复、染色体定位、基因结构、保守基序和系统进化等方面的分析.蒺藜苜蓿WRKY基因家族中最近共发生了11次基因重复事件,共涉及24个基因,占全部WRKY基因的26％.染色体物理定位分析表明,蒺藜苜蓿WRKY基因在染色体上呈不均匀分布,存在6个基因簇.对WRKYⅢ型基因的进化分析表明,它们在长期的进化过程中受纯化选择压力.
WRKY基因傢族是植物基因組內一類重要的轉錄因子,參與植物許多生理生化過程,如植物髮育、代謝以及生物和非生物脅迫.目前,已在多種植物中鑒定齣WRKY基因傢族,但是關于蒺藜苜蓿(Medicago truncatula L.) WRKY基因傢族的繫統分析鮮有報道.文章利用生物信息學方法,從蒺藜苜蓿全基因組中共鑒定齣93箇WRKY基因,包括81箇標準的WRKY基因(19箇Ⅰ型基因,49箇Ⅱ型基因以及13箇Ⅲ型基因)和12箇非標準類型的WRKy基因.對這些WRKY基因進行瞭基因重複、染色體定位、基因結構、保守基序和繫統進化等方麵的分析.蒺藜苜蓿WRKY基因傢族中最近共髮生瞭11次基因重複事件,共涉及24箇基因,佔全部WRKY基因的26％.染色體物理定位分析錶明,蒺藜苜蓿WRKY基因在染色體上呈不均勻分佈,存在6箇基因簇.對WRKYⅢ型基因的進化分析錶明,它們在長期的進化過程中受純化選擇壓力.
WRKY기인가족시식물기인조내일류중요적전록인자,삼여식물허다생리생화과정,여식물발육、대사이급생물화비생물협박.목전,이재다충식물중감정출WRKY기인가족,단시관우질려목숙(Medicago truncatula L.) WRKY기인가족적계통분석선유보도.문장이용생물신식학방법,종질려목숙전기인조중공감정출93개WRKY기인,포괄81개표준적WRKY기인(19개Ⅰ형기인,49개Ⅱ형기인이급13개Ⅲ형기인)화12개비표준류형적WRKy기인.대저사WRKY기인진행료기인중복、염색체정위、기인결구、보수기서화계통진화등방면적분석.질려목숙WRKY기인가족중최근공발생료11차기인중복사건,공섭급24개기인,점전부WRKY기인적26％.염색체물리정위분석표명,질려목숙WRKY기인재염색체상정불균균분포,존재6개기인족.대WRKYⅢ형기인적진화분석표명,타문재장기적진화과정중수순화선택압력.
