CAJ | 학술논문

文章利用生物信息学方法对ω-6 和ω-3 脂肪酸脱氢酶基因家族的氨基酸序列特征、系统进化及功能分化进行分析.结果表明,ω-6 和ω-3 脂肪酸脱氢酶氨基酸序列均含有3 个保守的组氨酸基序(Hisbox).质体类ω-6 和ω-3 脂肪酸脱氢酶氨基酸N-端序列均有数目不等的信号肽区域,并且在信号肽区中部发现1 个由10 个氨基酸残基组成的相对保守的疏水区,推测为该类酶信号肽的功能区域.多数植物微体ω-6 和ω-3 脂肪酸脱氢酶氨基酸C-端均有KKXX-like motif 内质网滞留信号,而红花CtFAD2-3、CtFAD2-4、CtFAD2-5、CtFAD2-6 和CtFAD2-7 中没有检测到该滞留信号,但C-端序列富含芳香族氨基酸,同样具有内质网滞留信号的作用.系统进化分析可将所有序列分为4 大类,结果显示ω-3 脂肪酸脱氢酶在原核生物中由ω-6 脂肪酸脱氢酶基因进化而来;并且植物质体和微体类ω-3 脂肪酸脱氢酶均可再划分为单子叶和双子叶植物2 个亚类,表明植物质体和微体类ω-3 脂肪酸脱氢酶功能的分化早在单子叶和双子叶植物分化之前就已经形成;而植物微体类ω-6 脂肪酸脱氢酶可细分为种子特异表达型和组成性表达型两类,是在双子叶植物形成之后才开始分化的.各亚群间的功能分化位点分析表明,除植物 FAD3/植物 FAD2 外,在所有存在功能分化的亚群间,均存在后验概率值超过0.80 的氨基酸位点,而这些位点主要分布在Hisbox I 的前后两端以及Hisbox II 的前端,表明这些位点变化对蛋白质功能域的大小或构象有着重要影响,对于亚群间功能分化起着非常重要的作用.
문장이용생물신식학방법대ω-6 화ω-3 지방산탈경매기인가족적안기산서렬특정、계통진화급공능분화 진행분석.결과표명,ω-6 화ω-3 지방산탈경매안기산서렬균함유3 개보수적조안산기서(Hisbox).질체류ω-6 화ω-3 지방산탈경매안기산N-단서렬균유수목불등적신호태구역,병차재신호태구중부발현1 개유10 개안기 산잔기조성적상대보수적소수구,추측위해류매신호태적공능구역.다수식물미체ω-6 화ω-3 지방산탈경매안 기산C-단균유KKXX-like motif 내질망체류신호,이홍화CtFAD2-3、CtFAD2-4、CtFAD2-5、CtFAD2-6 화CtFAD2-7 중몰유검측도해체류신호,단C-단서렬부함방향족안기산,동양구유내질망체류신호적작용.계통진화분석가 장소유서렬분위4 대류,결과현시ω-3 지방산탈경매재원핵생물중유ω-6 지방산탈경매기인진화이래;병차식 물질체화미체류ω-3 지방산탈경매균가재화분위단자협화쌍자협식물2 개아류,표명식물질체화미체류ω-3 지 방산탈경매공능적분화조재단자협화쌍자협식물분화지전취이경형성;이식물미체류ω-6 지방산탈경매가세분 위충자특이표체형화조성성표체형량류,시재쌍자협식물형성지후재개시분화적.각아군간적공능분화위점분 석표명,제식물 FAD3/식물 FAD2 외,재소유존재공능분화적아군간,균존재후험개솔치초과0.80 적안기산위 점,이저사위점주요분포재Hisbox I 적전후량단이급Hisbox II 적전단,표명저사위점변화대단백질공능역적대 소혹구상유착중요영향,대우아군간공능분화기착비상중요적작용.