CAJ | 학술논문

黑色素瘤是一种极易发生转移的恶性皮肤肿瘤,具有高度的致死性.上皮-间充质细胞转化(Epithelial-mesenchymal transition,EMT)在胚胎发育过程中起到非常重要的作用,同时在肿瘤的发生和恶化过程中也扮演着重要的角色.miRNA具有广谱的调节能力,对于肿瘤发生和EMT形成都能产生不同程度的影响.本文整合黑色素瘤细胞系转录组和miRNA组测序数据,在转录组数据中筛选得到参与肿瘤EMT过程的基因,通过Mirsystem软件预测并从miRNA组数据中筛选出与之负相关的11个miRNA,包括miR-130a-3p、miR-130b-3p、miR-125a-5p、miR-30a-3p、miR-195-5p、miR-345-5p、miR-509-3-5p、miR-374a-5p、miR-509-5p、miR-148a-3p和miR-330-3p.经过生物信息学分析miRNA靶基因富集的分子网络和信号途径,发现了两个与细胞发育和细胞间相互作用密切相关的网络,以及多个参与调控EMT过程的信号通路.对11个miRNA进行分子生物学验证,发现miR-195-5p、miR-130a-3p、miR-509-5p和miR-509-3-5p共4个可以调节重要肿瘤基因的miRNA.本研究运用mRNA和miRNA两种转录组的测序数据筛选EMT相关miRNA的方法,为肿瘤多组学数据整合分析提供了新的研究思路,并以期能为肿瘤精准基因组学的发展发挥重要的推进作用.
흑색소류시일충겁역발생전이적악성피부종류,구유고도적치사성.상피-간충질세포전화(Epithelial-mesenchymal transition,EMT)재배태발육과정중기도비상중요적작용,동시재종류적발생화악화과정중야분연착중요적각색.miRNA구유엄보적조절능력,대우종류발생화EMT형성도능산생불동정도적영향.본문정합흑색소류세포계전록조화miRNA조측서수거,재전록조수거중사선득도삼여종류EMT과정적기인,통과Mirsystem연건예측병종miRNA조수거중사선출여지부상관적11개miRNA,포괄miR-130a-3p、miR-130b-3p、miR-125a-5p、miR-30a-3p、miR-195-5p、miR-345-5p、miR-509-3-5p、miR-374a-5p、miR-509-5p、miR-148a-3p화miR-330-3p.경과생물신식학분석miRNA파기인부집적분자망락화신호도경,발현료량개여세포발육화세포간상호작용밀절상관적망락,이급다개삼여조공EMT과정적신호통로.대11개miRNA진행분자생물학험증,발현miR-195-5p、miR-130a-3p、miR-509-5p화miR-509-3-5p공4개가이조절중요종류기인적miRNA.본연구운용mRNA화miRNA량충전록조적측서수거사선EMT상관miRNA적방법,위종류다조학수거정합분석제공료신적연구사로,병이기능위종류정준기인조학적발전발휘중요적추진작용.