计算机工程与应用
計算機工程與應用
계산궤공정여응용
COMPUTER ENGINEERING AND APPLICATIONS
2007年
13期
30-32,75
,共4页
史晓红%王燕%张凯%罗亮%许进
史曉紅%王燕%張凱%囉亮%許進
사효홍%왕연%장개%라량%허진
蛋白质结构预测%二硫键%图%匹配
蛋白質結構預測%二硫鍵%圖%匹配
단백질결구예측%이류건%도%필배
在蛋白质结构预测的研究中,一个重要的问题就是正确预测二硫键的连接,二硫键的准确预测可以减少蛋白质构像的搜索空间,有利于蛋白质的3D结构的预测.论文将一个蛋白质结构中二硫键的预测问题,等价为一个寻找图的最大权的匹配问题.图的顶点表示序列中的半胱氨酸残基,边连接每一顶点,表示一种可能的连接方式,边的权根据一个权值函数赋值,用EJ算法寻找具有最大权的匹配,则这个匹配对应二硫键的正确连接.应用这个方法对蛋白质结构的二硫键进行了预测并取得了良好的结果.
在蛋白質結構預測的研究中,一箇重要的問題就是正確預測二硫鍵的連接,二硫鍵的準確預測可以減少蛋白質構像的搜索空間,有利于蛋白質的3D結構的預測.論文將一箇蛋白質結構中二硫鍵的預測問題,等價為一箇尋找圖的最大權的匹配問題.圖的頂點錶示序列中的半胱氨痠殘基,邊連接每一頂點,錶示一種可能的連接方式,邊的權根據一箇權值函數賦值,用EJ算法尋找具有最大權的匹配,則這箇匹配對應二硫鍵的正確連接.應用這箇方法對蛋白質結構的二硫鍵進行瞭預測併取得瞭良好的結果.
재단백질결구예측적연구중,일개중요적문제취시정학예측이류건적련접,이류건적준학예측가이감소단백질구상적수색공간,유리우단백질적3D결구적예측.논문장일개단백질결구중이류건적예측문제,등개위일개심조도적최대권적필배문제.도적정점표시서렬중적반광안산잔기,변련접매일정점,표시일충가능적련접방식,변적권근거일개권치함수부치,용EJ산법심조구유최대권적필배,칙저개필배대응이류건적정학련접.응용저개방법대단백질결구적이류건진행료예측병취득료량호적결과.
