分析化学
分析化學
분석화학
CHINESE JOURNAL OF ANALYTICAL CHEMISTRY
2009年
1期
144-151
,共8页
杨星%张纪阳%朱云平%谢红卫
楊星%張紀暘%硃雲平%謝紅衛
양성%장기양%주운평%사홍위
定量蛋白质组%质谱%稳定同位素标记%定量算法%评述
定量蛋白質組%質譜%穩定同位素標記%定量算法%評述
정량단백질조%질보%은정동위소표기%정량산법%평술
蛋白质定量研究已成为蛋白质组学的热点,它是疾病相关生物标志物发现的重要途径.基于稳定同位素标记的质谱分析技术是蛋白质定量最常用的方法之一.随着实验方法的发展和改进,定量数据处理方法也在不断更新与完善.一般来说,定量数据处理包括四步:搜库鉴定、图谱定量信息提取与计算、肽段丰度比计算和蛋白质丰度比计算及差异显著性分析,其中后三步是数据处理的核心.目前,后三步中每步都有多种可选算法,这些算法一般都是针对特定实验技术而提出的,缺乏深入的工作对它们进行系统比较和优化.为此,在总结目前主要实验技术方法的基础上,论述了定量算法的现状和存在问题,并针对一些问题提出了可行的解决办法.
蛋白質定量研究已成為蛋白質組學的熱點,它是疾病相關生物標誌物髮現的重要途徑.基于穩定同位素標記的質譜分析技術是蛋白質定量最常用的方法之一.隨著實驗方法的髮展和改進,定量數據處理方法也在不斷更新與完善.一般來說,定量數據處理包括四步:搜庫鑒定、圖譜定量信息提取與計算、肽段豐度比計算和蛋白質豐度比計算及差異顯著性分析,其中後三步是數據處理的覈心.目前,後三步中每步都有多種可選算法,這些算法一般都是針對特定實驗技術而提齣的,缺乏深入的工作對它們進行繫統比較和優化.為此,在總結目前主要實驗技術方法的基礎上,論述瞭定量算法的現狀和存在問題,併針對一些問題提齣瞭可行的解決辦法.
단백질정량연구이성위단백질조학적열점,타시질병상관생물표지물발현적중요도경.기우은정동위소표기적질보분석기술시단백질정량최상용적방법지일.수착실험방법적발전화개진,정량수거처리방법야재불단경신여완선.일반래설,정량수거처리포괄사보:수고감정、도보정량신식제취여계산、태단봉도비계산화단백질봉도비계산급차이현저성분석,기중후삼보시수거처리적핵심.목전,후삼보중매보도유다충가선산법,저사산법일반도시침대특정실험기술이제출적,결핍심입적공작대타문진행계통비교화우화.위차,재총결목전주요실험기술방법적기출상,논술료정량산법적현상화존재문제,병침대일사문제제출료가행적해결판법.