CAJ | 학술논문

为了进一步了解和认识CuZnSOD基因的结构和功能,揭示CuZnSOD对猪抗氧化机能的影响,寻找与肉质性状相关联的分子标记,文章采用RACE(Rapid amplification of cDNA end)方法,对莱芜猪CuZnSOD基因cDNA进行克隆测序,分析其结构和功能,并用Real-timePCR检测CuZnSOD基因的表达.结果表明,CuZnSOD基因cDNA序列全长658 bp(GenBank登录号:GU944822),包含76 bp的5'UTR和120 bp的3'UTR序列.全部CDS序列462 bp,编码153个氨基酸,分子量为15.9 kDa,等电点为6.03.CuZnSOD基因编码的氨基酸序列中,第3氨基酸残基处存在1个O-糖基化位点,第86氨基酸残基处存在1个N-糖基化位点.二级结构中α螺旋仅占1.31%.在进化过程中高度保守,与人、牛、小鼠和褐鼠的编码区同源性分别为87.74%、87.66%、83.44%和83.23%;氨基酸序列同源性分别为90.26%、94.12%、92.21%和91.50%.CuZnSOD存在典型的金属结合配体结构域(GFHVHQFGDNT).基于蛋白序列所构建的分子进化树表明猪与牛的亲缘关系最近.在mRNA水平上,CuZnSOD是一个广谱表达基因,在大脑、心脏、脾脏、肝脏、肾脏、肺、大肠、小肠、脊髓,肌肉、背膘和胃中都能检测到,其在肾脏,小肠和肺中表达量较高,在心脏和肌肉组织中表达量较低.
위료진일보료해화인식CuZnSOD기인적결구화공능,게시CuZnSOD대저항양화궤능적영향,심조여육질성상상관련적분자표기,문장채용RACE(Rapid amplification of cDNA end)방법,대래무저CuZnSOD기인cDNA진행극륭측서,분석기결구화공능,병용Real-timePCR검측CuZnSOD기인적표체.결과표명,CuZnSOD기인cDNA서렬전장658 bp(GenBank등록호:GU944822),포함76 bp적5'UTR화120 bp적3'UTR서렬.전부CDS서렬462 bp,편마153개안기산,분자량위15.9 kDa,등전점위6.03.CuZnSOD기인편마적안기산서렬중,제3안기산잔기처존재1개O-당기화위점,제86안기산잔기처존재1개N-당기화위점.이급결구중α라선부점1.31%.재진화과정중고도보수,여인、우、소서화갈서적편마구동원성분별위87.74%、87.66%、83.44%화83.23%;안기산서렬동원성분별위90.26%、94.12%、92.21%화91.50%.CuZnSOD존재전형적금속결합배체결구역(GFHVHQFGDNT).기우단백서렬소구건적분자진화수표명저여우적친연관계최근.재mRNA수평상,CuZnSOD시일개엄보표체기인,재대뇌、심장、비장、간장、신장、폐、대장、소장、척수,기육、배표화위중도능검측도,기재신장,소장화폐중표체량교고,재심장화기육조직중표체량교저.