山东医药
山東醫藥
산동의약
SHANDONG MEDICAL JOURNAL
2012年
33期
5-8
,共4页
曾融%张积仁%姜茂竹%麦仲伦%吴钢%郑燕芳
曾融%張積仁%薑茂竹%麥仲倫%吳鋼%鄭燕芳
증융%장적인%강무죽%맥중륜%오강%정연방
乳腺肿瘤%受体,Her2%小RNA病毒%计算机生物学
乳腺腫瘤%受體,Her2%小RNA病毒%計算機生物學
유선종류%수체,Her2%소RNA병독%계산궤생물학
目的 通过文献挖掘与生物信息学分析的方法,探讨Her2(+)/Her2(-)乳腺癌之间差异表达的microRNAs可能涉及的生物学功能和信号通路.方法 在NCBI数据库的GEO子数据库及EBI数据库中的ArrayExpress子数据库开展检索,使用关键词“breast cancer”、“microRNA”进行检索,获取Her2(+ )/Her2(-)乳腺癌之间差异表达microRNAs.利用microRNAs靶基因预测软件预测所有差异表达microRNAs的靶基因,进行通路分析.结果 找到2个在Her2表型不同的乳腺癌中差异表达的microRNAs数据集,利用软件TargetScan预测差异表达microRNAs的靶向基因,取其合集进行富集分析,最后将富集得到的基因利用David数据库进行分析,从而得到了上述差异表达的microRNAs可能具有的生物学功能和参与的调节通路.结论 差异表达的microRNAs通过调节靶向基因参与不同信号通路,实现多种生物学功能.
目的 通過文獻挖掘與生物信息學分析的方法,探討Her2(+)/Her2(-)乳腺癌之間差異錶達的microRNAs可能涉及的生物學功能和信號通路.方法 在NCBI數據庫的GEO子數據庫及EBI數據庫中的ArrayExpress子數據庫開展檢索,使用關鍵詞“breast cancer”、“microRNA”進行檢索,穫取Her2(+ )/Her2(-)乳腺癌之間差異錶達microRNAs.利用microRNAs靶基因預測軟件預測所有差異錶達microRNAs的靶基因,進行通路分析.結果 找到2箇在Her2錶型不同的乳腺癌中差異錶達的microRNAs數據集,利用軟件TargetScan預測差異錶達microRNAs的靶嚮基因,取其閤集進行富集分析,最後將富集得到的基因利用David數據庫進行分析,從而得到瞭上述差異錶達的microRNAs可能具有的生物學功能和參與的調節通路.結論 差異錶達的microRNAs通過調節靶嚮基因參與不同信號通路,實現多種生物學功能.
목적 통과문헌알굴여생물신식학분석적방법,탐토Her2(+)/Her2(-)유선암지간차이표체적microRNAs가능섭급적생물학공능화신호통로.방법 재NCBI수거고적GEO자수거고급EBI수거고중적ArrayExpress자수거고개전검색,사용관건사“breast cancer”、“microRNA”진행검색,획취Her2(+ )/Her2(-)유선암지간차이표체microRNAs.이용microRNAs파기인예측연건예측소유차이표체microRNAs적파기인,진행통로분석.결과 조도2개재Her2표형불동적유선암중차이표체적microRNAs수거집,이용연건TargetScan예측차이표체microRNAs적파향기인,취기합집진행부집분석,최후장부집득도적기인이용David수거고진행분석,종이득도료상술차이표체적microRNAs가능구유적생물학공능화삼여적조절통로.결론 차이표체적microRNAs통과조절파향기인삼여불동신호통로,실현다충생물학공능.
