分析化学
分析化學
분석화학
CHINESE JOURNAL OF ANALYTICAL CHEMISTRY
2009年
10期
1473-1478
,共6页
蛋白质库搜索算法%串联质谱%多变量判别分析%Decoy蛋白质序列库
蛋白質庫搜索算法%串聯質譜%多變量判彆分析%Decoy蛋白質序列庫
단백질고수색산법%천련질보%다변량판별분석%Decoy단백질서렬고
SEQUEST与Mascot为目前蛋白组学分析研究中使用最为广泛的蛋白质库搜索工具.尝试将Mascot与SEQUEST搜索结果进行比较,进而采用不同多变量判别方法对二者的搜索结果进行判别分析,以降低其结果的假阳性率.通过对Mascot与SEQUEST搜索结果进行比较,发现所得结果差异很大;利用多变量判别分析方法对Mascot及SEQUEST搜索结果进行判别分析,可有效提高SEQUEST结果中假阳性结果与正确结果之间的区分能力.对于Mascot搜索结果,采用多变量判别分析方法仍无法显著降低其假阳性结果,利用Decoy库搜索结果进行估计时亦存在导致错误估计的风险.
SEQUEST與Mascot為目前蛋白組學分析研究中使用最為廣汎的蛋白質庫搜索工具.嘗試將Mascot與SEQUEST搜索結果進行比較,進而採用不同多變量判彆方法對二者的搜索結果進行判彆分析,以降低其結果的假暘性率.通過對Mascot與SEQUEST搜索結果進行比較,髮現所得結果差異很大;利用多變量判彆分析方法對Mascot及SEQUEST搜索結果進行判彆分析,可有效提高SEQUEST結果中假暘性結果與正確結果之間的區分能力.對于Mascot搜索結果,採用多變量判彆分析方法仍無法顯著降低其假暘性結果,利用Decoy庫搜索結果進行估計時亦存在導緻錯誤估計的風險.
SEQUEST여Mascot위목전단백조학분석연구중사용최위엄범적단백질고수색공구.상시장Mascot여SEQUEST수색결과진행비교,진이채용불동다변량판별방법대이자적수색결과진행판별분석,이강저기결과적가양성솔.통과대Mascot여SEQUEST수색결과진행비교,발현소득결과차이흔대;이용다변량판별분석방법대Mascot급SEQUEST수색결과진행판별분석,가유효제고SEQUEST결과중가양성결과여정학결과지간적구분능력.대우Mascot수색결과,채용다변량판별분석방법잉무법현저강저기가양성결과,이용Decoy고수색결과진행고계시역존재도치착오고계적풍험.